Hospital Medicare kompensacija reiškia pinigų sumą, kurią JAV Medicare programa moka ligoninėms. Nustatant, kas mokama, atsižvelgiama į tai, kokią paslaugą ligoninė teikia, ir paprastai neatsižvelgiama į ligoninės vietą. Žmonėms Topekoje ar Niujorke, kuriems atlikta tokio paties tipo širdies operacija, Medicare programa mokės tuos pačius tarifus. Medicare nustato, kas, jos nuomone, yra pagrįstas mokėjimas už tam tikrą suteiktą paslaugą, ir atitinkamai sumoka.
Nuo 1997 m. buvo šiek tiek pakeitimų, susijusių su ligoninės Medicare kompensavimu. Daugeliu atvejų „Medicare“ nemokės papildomai, jei nustato, kad ligoninėje atsiranda būklė, kuri atsirado dėl prastos priežiūros arba dėl žmogiškos klaidos. Kitaip tariant, dėl daugelio ligų, kurių galima išvengti, pvz., infekcijų ar pragulų, dėl kurių pacientas ilgiau lieka, nereikia papildomos kompensacijos ligoninei. Vieni pasisako už šią sistemą, o kiti tvirtina, kad ji neskatina ligoninių priimti tam tikrus pacientus, ypač mediciniškai pažeidžiamus.
Yra keletas ligoninių, kurios teigia, kad ligoninių Medicare kompensavimo normos nėra tinkamos. Gali būti padengta labai mažai faktinių išlaidų, o ligoninės, kurios privalo vartoti Medicare, kaip ir daugelis valstybinių ligoninių, gali patirti didžiausią naštą, bandydamos dirbti taikant itin mažas kompensavimo normas. Tai iš dalies gali sudaryti sumos, mokamos ne Medicare pacientams, ypač tiems, kurie neturi jokios draudimo formos. Tai taip pat gali būti užburtas ratas, nes dėl mažo finansavimo gali trūkti darbuotojų, mažesnis darbuotojų atlyginimas ir prastesnė darbuotojų kokybė, o tai savo ruožtu gali lemti daugiau žmogiškųjų klaidų arba pacientų aplaidumo ir mažiau sumokėtų pinigų už ilgesnį žmonių buvimą ligoninėje.
Tačiau vienas šios lygties aspektų yra „faktinės kainos“ nustatymas. Gana lengva nustatyti standartines išlaidas, tačiau tikrosios faktinės išlaidos gali būti kitoks dalykas. Ligoninės sudaro sutartis su draudėjais taikydamos daug skirtingų kompensavimo normų, o šios skirtingos paslaugų užmokesčio skalės nelabai pasako apie tikrąsias išlaidas. „Hospital Medicare“ kompensavimas neabejotinai sudaro išlaidų analizę žemoje darbo užmokesčio skalės dalyje, tačiau yra ir privačių draudikų, kurie už paslaugas nemoka daug daugiau.
Kitas būdas pažvelgti į ligoninės Medicare kompensavimą yra pažvelgti į Medicare A dalį, kurioje nustatoma kiekvieno paciento ligoninė ir kiekvieno paciento finansinė atsakomybė. Pagal šią Medicare dalį pacientas turi sumokėti tam tikrą sumą už stacionarinę priežiūrą, į kurią įeina daugiau nei 1000 JAV dolerių (USD) atskaitymas ir 100 JAV dolerių per dieną, jei hospitalizuojama kvalifikuotoje slaugos įstaigoje. Viena iš priežasčių, kodėl žmonės dažnai perka papildomą draudimą per Medicare, yra susirūpinimas dėl poreikio mokėti šiuos mokesčius.