AY chromosoma yra viena iš žmonių ir kitų žinduolių lyčių chromosomų, kurios genetinis kodas lemia, ar organizmas genetiškai bus vyriškas ar moteriškas. Y chromosomos buvimas paprastai sukelia vyriškos lyties asmenį, išskyrus tam tikrus genetinius sutrikimus. Papildoma chromosoma yra X chromosoma; moterų kariotipe paprastai yra dvi X chromosomos, o vyrai paveldi X ir Y.
Ne visi organizmai turi lytinių chromosomų, o tie, kurie turi, gali turėti sudėtingą paveldėjimo sistemą, kai kalbama apie lytį. Šiame straipsnyje daugiausia dėmesio skiriama Y chromosomos vaidmeniui žmonėms. Manoma, kad iš pradžių žmonių protėviai paveldėjo dvi iš esmės identiškas lyties chromosomas, o laikui bėgant jos išsiskyrė į X ir Y chromosomas. Y chromosoma yra šiek tiek trumpesnė už X chromosomą ir pirmiausia joje yra genetinės medžiagos, susijusios su vyriškomis lytinėmis savybėmis.
Vienas svarbiausių genų tarp 58 milijonų bazinių porų Y chromosomoje yra SRY genas, lemiantis sėklidžių susidarymą. Kai formuojasi sėklidės, įvyksta daugybė reakcijų, nes jos gamina lytinius hormonus, tokius kaip testosteronas, prisidedant prie antrinių lytinių požymių, tokių kaip krūtinės plaukai ir gilus balsas, išsivystymo. Šioje chromosomoje esanti genetinė medžiaga sudaro apie 2% bet kurios ląstelės genetinės medžiagos, palyginti nedaug, o istoriniai įrodymai rodo, kad ji kažkada buvo didesnė ir laikui bėgant iš tikrųjų mažėja.
Genetiniai sutrikimai, susiję su šia chromosoma, paprastai sukelia vaisingumo ar lytinių savybių vystymosi problemų. Kai kuriais atvejais žmonės paveldi papildomą X chromosomą, kuri baigiasi XXY kariotipu ir būkle, vadinama Klinefelterio sindromu. Tiriamasis yra vyras, bet gali turėti vaisingumo problemų ir kitų problemų.
Vyrai Y chromosomas perduoda savo sūnums, o jei jie turi Y chromosomos genetinių sutrikimų, jų sūnūs taip pat turės šiuos sutrikimus. Priešingai, jei jie yra X chromosomoje pastebėtų genetinių sutrikimų nešiotojai ir turi dukterų, jų dukterys taip pat taps nešiotojais ir gali susirgti sutrikimu, jei jis yra dominuojantis arba paveldės kitą sugedusio geno kopiją iš jų motinos. Vienas su lytimi susijusių genetinių sutrikimų pavyzdžių yra hemofilija, liga, dažniausiai pasireiškianti vyrams, kurie paveldi vieną pažeistą X chromosomą, o Y chromosomoje neturi atitinkamo alelio, kuris slopintų žalingo geno ekspresiją.