Šlapimo pūslės skausmo gydymas kiekvienam pacientui gali skirtis. Daugeliu atvejų gydytojas gali paskirti vaistus, kad sumažintų diskomfortą. Intersticinis cistitas yra kitas skausmingo šlapimo pūslės sindromo pavadinimas, kuris dažnai gydomas fizine terapija atlikus išsamų fizinį patikrinimą. Tam tikrų maisto produktų ir gėrimų, kurie gali sukelti paūmėjimą, pašalinimas gali būti dar vienas šlapimo pūslės skausmo gydymo būdas.
Tiems, kurie kenčia nuo pasikartojančio šlapimo pūslės skausmo, gali tekti įvertinti, ar priežastis gali būti kitos sveikatos būklės. Kai kuriais atvejais gastroenteritas ar kitos žarnyno problemos gali sukelti šlapimo pūslės skausmą. Šlapimo takų infekcija (UTI) taip pat gali sukelti skausmingą šlapimo pūslės sindromą. Antibiotikai dažnai skiriami UTI gydyti. Makšties mielių infekcija kai kurioms moterims taip pat gali sukelti šlapimo pūslės skausmą, kuris paprastai gydomas antibiotikais.
Kai kuriems pacientams, sergantiems lėtiniu šlapimo pūslės skausmu, simptomai gali pablogėti atliekant tam tikrą veiklą. Tai gali apimti sėdėjimą ilgą laiką arba važiavimą dviračiu. Kai kurie asmenys taip pat gali jausti šlapimo pūslės skausmą lytinio akto metu arba po jo. Kai kuriems pacientams psichoterapija padeda susidoroti su skausmingo šlapimo pūslės sindromo simptomais, susijusiais su įvairia veikla. Paprastai tai atliekama prižiūrint psichologui ar psichiatrui ir gali prireikti kelių seansų, kad būtų sėkmingas.
Stresas gali sustiprinti skausmingos šlapimo pūslės sindromo simptomus, todėl geriausia stresines situacijas kontroliuoti kiek įmanoma. Darbo valandų sutrumpinimas gali laikinai padėti kai kuriems pacientams. Taip pat gali būti naudinga atlikti tam tikrus atsipalaidavimo būdus ar pratimus. Kineziterapeutas gali parodyti šiuos metodus sesijos metu.
Elgesio modifikavimo terapija yra dar vienas būdas gydyti skausmingo šlapimo pūslės sindromo simptomus. Vienas iš būdų yra išmokyti pacientą kontroliuoti norą šlapintis. Daugeliui pacientų, kuriems taikoma tokia terapija, dažnas šlapinimasis, kuris dažnai yra vienas iš simptomų, susijusių su skausminga šlapimo pūsle, gali būti veiksmingai kontroliuojamas nenaudojant kitų vaistų.
Kai kuriems pacientams gali prireikti kateterizuoti skausmingą šlapimo pūslę. Paprastai tai atliekama, kai kiti metodai buvo nesėkmingi. Šlapimo kateterizacija atliekama į šlapimo pūslę įvedant guminį arba plastikinį vamzdelį, leidžiantį nutekėti šlapimui. Norint išvengti šalutinio poveikio ir skausmo padidėjimo, reikia naudoti mažiausią įmanomą kateterį.