Maliarija gydoma tam tikra vaistų klase, kuri nenuostabu yra žinoma kaip vaistai nuo maliarijos. Vaistai nuo maliarijos yra skirti atakuoti parazitus, kurie sukelia ligą, neleidžiant jiems plisti ir kartu juos nužudyti, kad jie negalėtų toliau sukelti infekcijos. Gydymo sėkmė skiriasi priklausomai nuo to, kokia maliarijos atmaina serga pacientas, ar parazitai yra atsparūs vaistams ir ar pacientas gali baigti reikiamų vaistų kursą, ar ne.
Ši uodų platinama infekcija žmones kankino šimtmečius, kol atradus chininą gydytojai galėjo gydyti šia liga sergančius pacientus. Tačiau chininui atsparios padermės greitai išsivystė, todėl mokslininkai buvo priversti dirbti su naujomis maliarijos gydymui skirtų vaistų klasėmis. Ši kova tarp tyrėjų ir parazitų tęsiasi iki šiol, o vaistų kompanijos nuolat tiria naujus gydymo būdus.
Jei pacientas serga vadinamąja nekomplikuota maliarija, jis gali būti gydomas ambulatoriškai, geriausia per 24 valandas nuo simptomų atsiradimo. Bus ištirtas paciento kraujas, siekiant nustatyti infekciją sukėlusią padermę, tada bus paskirti tinkami geriamieji vaistai. Medicinos specialistai turi atsižvelgti į paciento ligos istoriją, kartu su kitais vaistais, kuriuos pacientas gali vartoti, prieš nuspręsdami, kurį vaistą nuo maliarijos naudoti.
Pacientams, sergantiems sunkia maliarija, būtina hospitalizuoti, o vaistai švirkščiami į veną arba per žvakutes. Kai kurie vaistai, naudojami šiai ligos formai gydyti, yra sulfadoksino / pirimetamino ir atovakvono / proguanilo deriniai, taip pat meflokvino hidrochloridas, chinino sulfatas, chlorokvinas, doksiciklinas, primaquinas ir artemisino dariniai. Šių vaistų gydymo kaina skiriasi, ir tai yra dar vienas gydymo aspektas, nes pacientams svarbu baigti vartoti visą vaistų kursą; kitu atveju gali išsivystyti vaistams atspari maliarija.
Žinoma, geriausias maliarijos gydymo būdas yra jos prevencija. Profilaktiniai vaistai primygtinai rekomenduojami žmonėms, gyvenantiems ar keliaujantiems ten, kur liga yra endeminė, tačiau, deja, daugelis besivystančių šalių žmonių negali sau leisti profilaktinių vaistų kursų. Kai kurios labdaros organizacijos tokius vaistus nemokamai teikia besivystančių šalių bendruomenėms, tačiau sunku gauti visą aprėptį tokiose srityse kaip Afrika į pietus nuo Sacharos ir Pietryčių Azija. Maliarijos riziką taip pat galima sumažinti naudojant tinklelį nuo uodų lovoms uždengti, uždengiant langus ir naudojant vabzdžių repelentus, kad uodai ir kiti vabzdžiai būtų apsaugoti nuo vabzdžių.