Yra keletas antibiotikų vartojimo pavojų, į kuriuos reikia atsižvelgti priimant sprendimą dėl antibiotikų vartojimo. Istoriškai per didelis antibiotikų skyrimas buvo didelė problema, iš dalies dėl pacientų spaudimo, todėl gydytojai šiuo metu permąsto šių vaistų skyrimo ir vartojimo būdus. Pacientai, kurie mokosi apie antibiotikų vartojimo riziką, gali geriau pasirinkti vaistus, kuriuos jie vartoja.
Viena didžiausių pavojų yra bendruomenės rizika, ty padidėjęs atsparumas antibiotikams. Kuo dažniau skiriami antibiotikai, tuo didesnė organizmo atsparumo tikimybė. Žmonės, kurių imuninė sistema susilpnėjusi, rizikuoja užsikrėsti vaistams atspariais organizmais, o kitu atveju sveiki asmenys dėl atsparios infekcijos gali mirti arba patirti rimtų medicininių komplikacijų. Siekiant visos bendruomenės gerovės, daugelis medicinos institucijų pataria apriboti antibiotikų vartojimą.
Kita antibiotikų vartojimo rizika asmenims yra ta, kad šie vaistai dažnai skiriami esant būklei, kurios jie negali gydyti. Ausų infekcijas, kosulį ir peršalimą dažnai sukelia virusai, o ne bakterijos. Šios sąlygos praeina savaime be medicininio gydymo. Tokiais atvejais antibiotikų skirti nereikia, todėl pacientams kyla šalutinio antibiotikų poveikio rizika.
Šalutinis antibiotikų poveikis yra sunkios alerginės reakcijos, viduriavimas, pykinimas, vėmimas ir bėrimas. Antibiotikai naikina gerąsias bakterijas kartu su blogosiomis ir sutrikdys žarnyno floros pusiausvyrą, sukeldami virškinimo trakto sutrikimus. Kita antibiotikų vartojimo rizika yra žalinga vaistų sąveika. Antibiotikai gali reaguoti su daugeliu vaistų nuo hormoninės kontracepcijos iki kraujo skiediklių, sukeldami potencialiai rimtų medicininių komplikacijų.
Antibiotikų vartojimo rizika apima antibiotikų vartojančių žmonių pažeidžiamumą oportunistinėms infekcijoms ir susilpnėjusį imuninį atsaką žmonėms, kurie per savo gyvenimą daug vartojo šiuos vaistus. Kai kurie žmogaus imunodeficito viruso (ŽIV) tyrimai rodo, kad žmonėms, kurių imuninė sistema susilpnėjusi, yra didesnė rizika užsikrėsti ŽIV ir jiems yra didesnė tikimybė susirgti dideliu virusų kiekiu, kuris progresuos iki visiško įgyto imunodeficito sindromo. AIDS).
Skiriant antibiotikus, rekomenduojama pasiteirauti gydytojo, kodėl skiriami vaistai, kaip juos vartoti, ar yra alternatyvių gydymo būdų. Pacientai gali norėti paklausti, ar infekcija praeis savaime be antibiotikų kurso. Jie taip pat turėtų paklausti, kaip atsakingai išmesti vaistų likučius.