Klonidino nutraukimo simptomų yra daug ir jie svyruoja nuo lengvo skrandžio sutrikimo iki sunkaus ir pavojingo kraujospūdžio padidėjimo. Papildomas poveikis yra galvos skausmas, miego sutrikimai, regėjimo pokyčiai ir į gripą panašūs pojūčiai. Pacientams gali atsirasti kitų nerimą keliančių požymių, tokių kaip drebulys, karščiavimas, haliucinacijos ir didelis nerimas. Šių reakcijų galima išvengti lėtai mažinant vaisto dozę, o vėl pradėjus vartoti staiga nutrauktą vaistą, gali išnykti sunkūs simptomai.
Paprastai klonidino vartojimą nutrauks pacientai, jei jie staiga nustos vartoti vaistą be nuoseklaus mažėjimo. Tai reiškia, kad visiems, vartojantiems šį vaistą, reikia gydytojo patarimo, kaip saugiai nutraukti jo vartojimą. Svarbu pabrėžti, kad net trumpalaikis vartojimas gali sukelti abstinenciją. Visi pacientai, vartojantys vaistus, turi turėti gydytojo parengtą laipsniško mažinimo planą, skirtą nutraukti gydymą.
Vienas didžiausių rūpesčių, susijusių su abstinencija, yra tai, kad jis gali sukelti hipertenzinę krizę. Vaistas mažina ir reguliuoja kraujospūdį. Staigus jo nebuvimas gali sukelti pavojingai aukštą kraujospūdžio lygį, kuris kartais gali būti mirtinas. Kiti sunkūs staigaus vartojimo nutraukimo simptomai yra haliucinacijos, stiprus pykinimas ir (arba) vėmimas bei dideli nuotaikos pokyčiai. Pastarasis gali būti ypač pavojingas žmonėms, sergantiems tokiomis ligomis kaip bipolinis sutrikimas.
Nors daugelis žmonių nepatirs sunkiausių abstinencijos simptomų, šių reakcijų įvairovė gali sukelti išskirtinį diskomfortą. Kai pacientai atsisako vartoti vaistą, tai gali turėti neigiamos įtakos nuotaikai, kūno temperatūrai, skrandžio veiklai ir pažinimui. Kitaip tariant, žmonės gali pasijusti labai blogai, kai staiga nutraukia gydymą, ir šie jausmai gali trukti kelias dienas ar ilgiau. Be to, sunku numatyti abstinencijos baigtį ir beveik neįmanoma nustatyti, ar pacientams gali kilti gyvybei pavojingų reakcijų.
Užuot leisdami pacientams nutraukti klonidino vartojimą, gydytojai paprastai sukuria siauresnį gydymo nutraukimo planą. Smailėjimas gali užtrukti nuo kelių dienų iki kelių savaičių. Tai iš esmės apima nuolat mažėjančias dozes kiekvieną dieną, kad būtų išvengta neigiamų simptomų. Konkretus paros sumažinimo dydis gali būti pakeistas, jei pacientas pradeda nutraukti gydymą. Be to, kai žmonės staiga nutraukė klonidino vartojimą, gydymo šiuo vaistu atnaujinimas gali sustabdyti daugumą neigiamų simptomų.
Ironiška, bet klonidinas yra naudingas vaistas, padedantis atsikratyti kitų rūšių narkotikų, tokių kaip benzodiazepinai ir opiatai. Tai padeda pašalinti neigiamus simptomus, kurie gali atsirasti žmonėms nustojus vartoti šias medžiagas. Kai naudojamas šiam tikslui, gydymas paprastai trunka tik nuo kelių dienų iki savaitės. Nepaisant to, kadangi tie patys pacientai taip pat gali nukentėti nuo klonidino abstinencijos, gydymo pabaigoje vaisto vartojimas dažnai sumažinamas, kad būtų išvengta šių simptomų.