Dažniausias ilgalaikis prednizono poveikis yra tas, kad jis gali palengvinti jo paskirto sutrikimo simptomus, tokius kaip alerginės reakcijos, artritas ir vilkligė. Be šio pageidaujamo poveikio, yra ir nemažai nepageidaujamų ilgalaikių poveikių, kurie gali neigiamai paveikti paciento sveikatą. Prednizonas gali paveikti daugelį organizmo sistemų, įskaitant kaulus, odą, akis, imuninę sistemą ir virškinimo sistemą. Rimtos būklės atsiradimo tikimybė didėja vartojant ilgą laiką, nors dauguma pacientų nepatiria nė vieno iš šių galimų padarinių.
Pacientams, sergantiems tam tikromis uždegiminėmis ligomis, gali būti skiriamas prednizonas. Teigiamas ilgalaikis prednizono poveikis yra sumažėjęs uždegimas ir dirginimas įvairiose kūno dalyse, įskaitant plaučius, sąnarius ir odą. Tai gali palengvinti daugelio lėtinių ligų simptomus ir suteikti žmogui galimybę pasveikti.
Daugelis galimų ilgalaikių prednizono poveikių neigiamai veikia paciento kūną. Buvo žinoma, kad šis vaistas veikia tiek vyrų, tiek moterų reprodukcines sistemas. Moterims prednizonas gali sukelti nereguliarias mėnesines. Vyrams impotencija siejama su ilgalaikiu vaisto vartojimu.
Yra keletas ilgalaikių prednizono padarinių, kurie taip pat gali pakenkti paciento akims. Šio vaisto vartojimas gali sukelti kataraktą ar glaukomą. Negydomos šios sąlygos gali sukelti dalinį arba visišką aklumą, kuris yra negrįžtamas.
Prednizonas taip pat gali trukdyti kūno chemijai, todėl organizmui sunku subalansuoti tam tikrus hormonus. Visų pirma, prednizonas gali trikdyti pagumburio-hipofizės-antinksčių ašį. Tai sistema, reguliuojanti daugybę dalykų organizme, įskaitant virškinimą, stresą, imuninį atsaką ir nuotaiką. Ilgą laiką vartojant prednizoną, gali kilti problemų dėl žmogaus gebėjimo subalansuoti šiuos hormonus, o tai gali sukelti problemų bet kurioje iš šių hormonų reguliuojamų sistemų.
Ilgalaikis prednizono vartojimas taip pat gali turėti įtakos paciento raumenų ir kaulų sistemai. Gali atsirasti raumenų silpnumas, taip pat kaulų retėjimas, dėl kurio gali išsivystyti osteoporozė ir padidėti lūžių rizika. Daugelį šių sąlygų galima kontroliuoti vartojant maisto papildus ir kitus vaistus. Vaikams vienas iš ilgalaikių prednizono padarinių gali būti augimo sulėtėjimas, kurį turi atidžiai stebėti gydytojas.