Daugeliu atvejų virškinimo trakto infekcija praeina savaime po kelių dienų ir nereikalauja jokio specialaus gydymo. Svarbus tinkamas drėkinimas, todėl sveikstant reikia vartoti daug skysčių. Nereceptiniai arba receptiniai vaistai gali būti naudojami pykinimui, susijusiam su virškinimo trakto infekcija, gydyti, nors vaistai, skirti gydyti viduriavimą, paprastai nerekomenduojami. Atsižvelgiant į infekcijos priežastį, gali būti skiriami antibiotikai, antivirusiniai vaistai ar vaistai nuo parazitų. Bet kokius konkrečius klausimus ar rūpesčius dėl geriausių virškinimo trakto infekcijų gydymo galimybių konkrečioje situacijoje reikia aptarti su gydytoju ar kitu medicinos specialistu.
Tinkamos hidratacijos palaikymas yra vienas iš pagrindinių rūpesčių, kai yra virškinimo trakto infekcija. Norint išvengti dehidratacijos, dažnai pakanka gerti daug skysčių. Be vandens ir vaisių sulčių, gali būti rekomenduojama sriuba arba sultinys. Derinant šiuos maisto produktus ir gėrimus, organizme pakeičiami ir skysčiai, ir elektrolitai. Jei atsiranda dehidracija, pacientui gali tekti leisti į veną skysčių ligoninėje.
Pykinimas ir viduriavimas yra dažniausiai pasitaikantys simptomai, susiję su virškinimo trakto infekcija. Jei pykinimas tampa stiprus ir sunku išlaikyti skysčių kiekį, gali būti naudingi nereceptiniai arba receptiniai vaistai nuo pykinimo. Paprastai nerekomenduojama vartoti vaistų, skirtų viduriavimui gydyti, nes tai sulėtintų infekcijos šaltinio pasišalinimą.
Antibiotikai paprastai neskiriami esant bakterinei virškinimo trakto infekcijai, kitaip sveikam žmogui. Šie vaistai turi tendenciją sustiprinti simptomus, tokius kaip viduriavimas. Tiems, kurių imuninė sistema susilpnėjusi, gali būti skiriami antibiotikai, nes tada nauda būtų didesnė už galimą riziką. Nustačius, kad infekciją sukėlė parazitas, gali būti skiriami vaistai nuo parazitų, o esant virusinėms infekcijoms – antivirusiniai vaistai.
Geriausios virškinimo trakto infekcijos gydymo galimybės paprastai yra pakankamas skysčių vartojimas ir daug poilsio. Tai gana dažna bėda ir paprastai praeina savaime per savaitę. Jei simptomai išlieka arba tampa sunkūs, reikia kreiptis į gydytoją dėl tolesnio medicininio įvertinimo. Gali būti skiriami vaistai, padedantys palengvinti simptomus, arba gali būti nurodytas trumpas buvimas ligoninėje, jei dehidratacija tampa sunki ir negali būti tinkamai gydoma namuose. Visada geriausia, kad infekciją diagnozuotų gydytojas, nes kai kurios rimtesnės sveikatos būklės gali turėti panašių simptomų.