Midazolamo šalutinis poveikis paprastai yra lengvas ir nekelia jokio reikšmingo pavojaus sveikatai, nors apie bet kokius naujus ar varginančius simptomus, atsirandančius pradėjus gydymą šiuo vaistu, reikia pranešti gydytojui, kad jis tolimesniam įvertinimui. Kai kurie iš dažniausiai praneštų šio raminamojo šalutinio poveikio yra pykinimas, neryškus matymas ir mieguistumas. Rimtesni šalutiniai poveikiai, apie kuriuos reikia nedelsiant pranešti gydytojui, yra nereguliarus širdies plakimas, traukuliai ir pasunkėjęs kvėpavimas. Konkrečius klausimus ar rūpesčius dėl galimo šalutinio poveikio reikia aptarti su vaistą skiriančiu gydytoju.
Mieguistumas ir galvos svaigimas yra labiausiai paplitęs midazolamo šalutinis poveikis, nes šis vaistas vartojamas siekiant padėti nuraminti pacientus prieš tam tikras medicinines procedūras ar operacijas. Daugelis šio vaisto vartojančių žmonių taip pat praneša apie pykinimą ir vėmimą, o siekiant sumažinti šių simptomų sunkumą, dažnai skiriami papildomi vaistai. Gausus vėmimas gali sukelti komplikacijų, tokių kaip dehidratacija arba virškinamojo trakto pažeidimas. Jei midazolamas suleidžiamas injekcijos forma, gali atsirasti odos dirginimas ir diskomfortas injekcijos vietoje.
Neryškus matymas, burnos džiūvimas ir kosulys yra gana dažnas šalutinis poveikis, kuris paprastai išnyksta nutraukus vaisto vartojimą. Sumažėjęs kalio kiekis yra galimas šio vaisto vartojimo pasekmė, todėl gali prireikti laikinų papildų. Gali atsirasti koordinacijos stoka arba raumenų kontrolės praradimas, ypač jei vartojama per daug šio vaisto ir atsiranda per daug sedacija.
Vartojant midazolamo buvo pranešta apie sunkų su širdimi susijusį šalutinį midazolamo poveikį, todėl vaistą skiriančiam gydytojui reikia pranešti apie bet kokias širdies ligas. Nereguliarus širdies plakimas, staigūs kraujospūdžio pokyčiai arba krūtinės skausmas gali rodyti galimai gyvybei pavojingų komplikacijų atsiradimą, todėl medicinos specialistas turėtų juos nedelsiant įvertinti. Traukuliai, nekontroliuojami raumenų judesiai arba staigus negalėjimas normaliai kalbėti taip pat yra vienas iš galimų midazolamo šalutinių poveikių.
Alerginės reakcijos galimos vartojant bet kokius vaistus, įskaitant midazolamą, net jei praeityje vaistas buvo gerai toleruojamas. Lengvos reakcijos gali sukelti odos bėrimą, niežėjimą ar pūsles. Buvo žinoma, kad sunkesnis alerginės reakcijos tipas, žinomas kaip anafilaksija, sukelia staigią mirtį ir reikalauja skubios medicinos pagalbos. Dažni anafilaksiniai simptomai yra liežuvio ar gerklės patinimas, pasunkėjęs kvėpavimas ir sąmonės netekimas. Galimas ir kitas šalutinis poveikis, todėl svarbu bet kokius asmeninius rūpesčius aptarti su prižiūrinčiu gydytoju arba slaugytoju.