Fluoksetino dozės nustatomos pagal amžių, gydomą būklę ir vaisto formos tipą. Jiems taip pat turi įtakos paciento atsakas, nes tai yra patikimiausia priemonė nustatyti vaisto ir dozės veiksmingumą. Pacientai gali vartoti kitus vaistus, kurie gali paveikti atsaką arba tiesiogiai paveikti fluoksetino, dažnai parduodamo Prozac® pavadinimu, veikimą ir metabolizmą organizme. Tokiais atvejais gali reikėti koreguoti dozes.
Pirmiausia reikia atsižvelgti į paciento amžių, o vaikams iki septynerių metų dažniausiai vaistas neskiriamas. Vaikai nuo septynerių metų iki paauglystės gali gauti fluoksetino dozes, kurios svyruoja nuo 10 iki 60 mg esant tokioms ligoms kaip didžioji depresija, obsesinis-kompulsinis sutrikimas (OKS) arba nervinė bulimija. Jaunesni vaikai paprastai gauna mažesnes dozes, tačiau būklė taip pat turi didelę įtaką. OCD dozė gali padidėti iki 60 mg jaunesniems nei 18 metų amžiaus žmonėms, tačiau vaikams skirtos depresijos dozės paprastai neviršija 20 mg. Kaip ir daugelis antidepresantų, fluoksetinas paprastai pradedamas vartoti mažesne doze ir per kelias savaites didinama iki palaikomosios dozės.
Amžius taip pat turi įtakos dozės kiekiui kitu būdu. Jei fluoksetinas vartojamas senyvo amžiaus žmonėms, dozės paprastai yra mažesnės nei „suaugusiųjų“ dozės. Rekomendacijos šiai populiacijai gali būti labiau panašios į rekomendacijas vaikams.
Suaugusieji, sergantys įvairiomis ligomis, vartoja fluoksetino dozes, kurios iš dalies priklauso nuo būklės ir jų reakcijos į vaistą. Pradinė terapija paprastai pradedama nuo 20 mg, tačiau esant tokioms sąlygoms kaip panikos sutrikimas, pradinė rekomenduojama dozė yra 10 mg. Sergant dideliu depresiniu sutrikimu, daugelis pacientų teigiamai reaguoja į pradinę 20 mg dozę, tačiau jei šios dozės nepakanka, dozės gali padidėti iki didžiausios 80 mg per parą. Sergant OKS, terapinė nauda paprastai būna nuo 20 iki 60 mg vaisto, tačiau kai kurie pacientai gali vartoti iki 80 mg.
Asmenys, sergantys bulimija, nereaguoja į mažesnes nei 60 mg fluoksetino dozes. Moterims, turinčioms priešmenstruacinį disforijos sutrikimą, rekomenduojamas labai skirtingas dozavimo grafikas. Jie gali vartoti 20–60 mg 14 dienų kiekvieną mėnesį iki mėnesinių pradžios.
Kitas dozavimo variantas yra su tabletėmis, žinomomis kaip „weekly Prozac®“. Šis vaistas gali būti tinkamas žmonėms, kurių būklė stabilizavosi, kuriai, atrodo, nereikia kasdienio gydymo. Jis vartojamas kartą per savaitę, paprastai po 20 mg.
Tam tikri vaistai, vartojami kartu su fluoksetinu, gali paveikti organizmo reakciją į vaistą arba jo pašalinimą. Vienas iš jų yra olanzapinas, netipinis antipsichozinis vaistas, kuris kartais skiriamas kartu su fluoksetinu, siekiant gydyti atsparią depresiją esant didžiojo depresinio sutrikimo ir bipolinio sutrikimo gydymui. Fluoksetino vartojimo bipoliniam sutrikimui išmintis yra abejotina, atsižvelgiant į jo potencialą sukelti manijos ir hipomanijos būsenas, tačiau praktika nėra nežinoma. Terapinis diapazonas yra nuo 25 iki 50 mg, kai vartojamas olanzapinas, ir abu vaistai yra kombinuotose tabletėse.