Daugybė įvairių sveikatos sutrikimų gydymo būdų gali apimti kaulų čiulpus. Kaulų čiulpų gydymas paprastai apima kaulų čiulpų transplantaciją, kai sveikos kamieninės ląstelės iš kaulų čiulpų persodinamos pacientui, kuriam trūksta sveikų kaulų čiulpų arba kuris negamina reikiamų ląstelių savo kaulų čiulpuose. Kaulų čiulpų gydymas paprastai vyksta ligoninėje ir gali apimti buvimą ligoninėje, atsižvelgiant į atliekamos procedūros tipą.
Atliekant kaulų čiulpų aspiraciją ir biopsiją, paimamas kažkieno kaulų čiulpų mėginys, dažniausiai iš dubens. Viena iš priežasčių tai daryti yra diagnostikos tikslais, kad kaulų čiulpus būtų galima ištirti laboratorinėmis sąlygomis. Tai taip pat gali būti atliekama siekiant surinkti kaulų čiulpus transplantacijai arba nustatyti kaulų čiulpų tipą, siekiant nustatyti, ar jie gali būti naudojami transplantacijai.
Kitas kaulų čiulpų gydymo būdas apima kaulų čiulpų veikimą chemoterapija, spinduliuote arba abiem. Tai dažnai naudojama ruošiant pacientą transplantacijai, nužudant ją arba jo kaulų čiulpus. Šiuo gydymo etapu pacientai yra labai pažeidžiami ir paprastai yra izoliuojami, kad nesusirgtų. Chemoterapija ir spinduliuotė taip pat gali būti naudojami bandant įveikti kaulų čiulpų vėžį, tikintis išsaugoti paciento kaulų čiulpus sunaikinant vėžio ląsteles.
Kalbant apie kaulų čiulpų transplantaciją, yra keletas variantų. Vienas iš jų apima kamieninių ląstelių persodinimą iš paciento virkštelės arba paciento kaulų čiulpų mėginio, paimto prieš pacientui taikant chemoterapiją ir spinduliuotę, vadinamą autologine donoryste. Pacientas taip pat gali gauti alogeninę kaulų čiulpų donorystę iš kito asmens, pavyzdžiui, šeimos nario ar nepažįstamo asmens, turinčio tinkamą kaulų čiulpų tipą. Galiausiai pacientams, kuriems pasisekė susilaukti dvynių, singeninė kaulų čiulpų transplantacija gali būti atliekama naudojant donoro čiulpus iš paciento dvynių.
Bet kurio kaulų čiulpų gydymo tikslas yra išspręsti tam tikras paciento kaulų čiulpų problemas. Ta problema gali būti vėžys, genetinė būklė, pažeidžianti kaulų čiulpų funkciją, arba kita medicininė problema. Kadangi kaulų čiulpai gamina kraujo ląsteles, jie yra nepaprastai svarbi kūno dalis, todėl kaulų čiulpų gydymas turi būti atliekamas atsargiai, kad pacientas nesukeltų nereikalingos rizikos.