Imunoterapijos šalutinis poveikis skiriasi priklausomai nuo konkretaus gydymo. Ši terapija apima vaistų, kurie aktyvina arba slopina imuninę sistemą, vartojimą. Pacientams, kuriems taikoma aktyvinimo imunoterapija, paprastai pasireiškia šaltkrėtis, karščiavimas ir reakcijos injekcijos vietoje. Dažnas slopinamųjų imunoterapijos šalutinis poveikis paprastai yra, bet tuo neapsiribojant, odos dirginimas, nuovargis ir infekcija.
Gydymas imuninei sistemai suaktyvinti apima vakcinaciją ir kovos su vėžiu terapiją. Vakcinacijos terapija apima aktyvaus arba neaktyvaus patogeno įvedimą, kad būtų sukurtas imunitetas prieš konkrečią ligą sukeliančią medžiagą. Nepaisant daugybės privalumų, vakcinos buvo susijusios su daugybe įprastų ir rimtų šalutinių poveikių.
Dažnas vakcinacijos šalutinis poveikis yra skausmas, skausmas ir patinimas injekcijos vietoje. Retesnis šalutinis poveikis yra nuovargis, raumenų skausmai ir karščiavimas. Priklausomai nuo dozės ir suleistos vakcinos tipo, simptomai turėtų trukti nuo kelių valandų iki kelių dienų. Rimtas vakcinų imunoterapijos šalutinis poveikis gali būti sunkios alerginės reakcijos, traukuliai ir net smegenų pažeidimai.
Vėžio imunoterapija skatina paciento organizmą atakuoti piktybines naviko ląsteles. Viena iš labiausiai paplitusių vėžio imunoterapijų apima monokloninių antikūnų, kurie padeda imuninei sistemai atakuoti naviko ląsteles, naudojimą. Su šiuo antikūnų gydymu susijęs šalutinis poveikis yra odos bėrimas, į gripą panašūs simptomai ir žemas kraujospūdis. Retesnis šalutinis poveikis yra kraujavimas, mažas elektrolitų kiekis ir rimti širdies negalavimai, įskaitant širdies nepakankamumą.
Slopinamosios imunoterapijos naudojamos įvairioms ligoms gydyti, įskaitant alergijas, autoimuninius sutrikimus ir organų transplantacijos atmetimą. Esant alergijai, siekiant sumažinti alerginių priepuolių skaičių, į paciento organizmą paprastai suleidžiamos imuninę sistemą desensibilizuojančios medžiagos. Dažniausias imunoterapijos šalutinis poveikis gydant alergiją yra paraudimas, patinimas ir skausmas injekcijos vietoje. Kai kuriems žmonėms pasireiškia rimtesnės reakcijos, pvz., dilgėlinė, švokštimas ir spaudimas krūtinėje.
Imunoterapija būtina persodinus organus ir esant sunkioms autoimuninių sutrikimų formoms dėl imuninės sistemos griaunamosios galios. Kūnas gali matyti persodintą organą kaip svetimkūnį, kurį reikia sunaikinti. Panašiai, autoimuniniai sutrikimai, tokie kaip sisteminė raudonoji vilkligė (SRV), yra susiję su pernelyg aktyvia imunine sistema, kuri nukreipia, puola ir naikina bet kokios formos audinius, raumenis ar organus. Imunitetą slopinančios medžiagos, tokios kaip ciklosporinai ir kortikosteroidai, slopina tam tikrus agentus, atsakingus už organų atmetimą ir autoimuninius sutrikimus.
Šie slopinamieji agentai buvo pripažinti pratęsiant persodintų organų gyvenimą ir sumažinant organų pažeidimus esant autoimuniniams sutrikimams, tačiau šie vaistai dažnai turi rimtų šalutinių poveikių. Vienas dažnas visų šių vaistų šalutinis poveikis yra padidėjusi infekcijos rizika. Pacientams, kurių imuninė sistema buvo susilpnėjusi, infekcija gali kelti didelį pavojų sveikatai. Kitas dažnas slopinančios imunoterapijos šalutinis poveikis yra pykinimas ir nuovargis. Be to, šalutinis poveikis, priskiriamas ilgalaikiam imunosupresinių vaistų vartojimui, yra vėžys ir organų disfunkcija.