Aftinės opos gydymas gali būti sudarytas iš burnos skalavimo ir geriamųjų ar vietinių vaistų. Taip pat gali padėti kai kurios namų gynimo priemonės, pavyzdžiui, magnezijos pieno naudojimas ir paciento dietos keitimas. Kai kuriais atvejais tai yra pagrindinės būklės, pvz., jautrumo maistui ar alergijos, požymis. Tokiu atveju taip pat reikia pašalinti priežastį. Lengvoms aftinėms opoms gydyti gali nereikėti, nes jos paprastai praeina savaime per savaitę ar dvi.
Pacientas, sergantis aftine opa, dažniau vadinama opa, kartais gali supainioti šią būklę su lūpų pūsleline. Peršalimo opos atsiranda ant lūpos, o burnos viduje atsiranda aftinės opos, kurios gali tapti skausmingos, todėl kalba ir valgymas gali būti problemiški. Varginančios aftinės opos gali būti padengtos tiršta pasta, pagaminta iš kepimo sodos ir vandens. Pacientas taip pat gali išbandyti naminį burnos skalavimo skystį, kurį sudaro druska ir vanduo arba soda ir vanduo.
Ledo drožlės taip pat gali būti naudojamos aftinės opos gydymui. Pacientas turėtų kelis kartus per dieną laikyti ledą ant žaizdos, kad sumažintų skausmą. Keletą kartų per dieną vietiškai užlašinus lašelį magnezijos pieno, gali paspartėti gijimas. Aštrų ar abrazyvų maistą taip pat galima papildyti gydant aftines opas. Kruopšti burnos higiena gali padėti išvengti aftinės opos išsivystymo bakterinės infekcijos.
Kai opa neužgyja per savaitę ar dvi arba yra sunki, pacientai turi kreiptis į gydytoją dėl aftinės opos gydymo. Receptinis burnos skalavimo skystis gali palengvinti uždegimą ir sumažinti diskomfortą. Jis taip pat gali paskirti pastą, kurioje yra fluocinonido, amleksanokso ar benzokaino, kad paspartintų gijimo procesą. Šios pastos turi būti tepamos lokaliai ant opos. Kitas vietinis aftinės opos gydymo būdas yra debakterolis, cheminis tirpalas.
Gydytojas taip pat gali rekomenduoti geriamuosius vaistus aftinės opos gydymui, įskaitant vaistus nuo rėmens. Rečiau kortikosteroidai gali būti naudojami, kai opa nereaguoja į kitus gydymo būdus. Pacientams, kurie valgo netinkamą mitybą, gali būti naudingi papildai, tokie kaip B grupės vitaminai ir geležis.
Aftinės opos kartais gali būti rimtesnės pagrindinės būklės požymis. Pacientai turi informuoti savo gydytojus apie visas kitas savo sveikatos būkles. Tai gali būti atsakas į maisto alergiją ar jautrumą. Norėdami papildyti aftinės opos gydymą, pacientai iš savo raciono turėtų pašalinti kenksmingus maisto produktus. Šios opos taip pat gali būti susilpnėjusios imuninės sistemos, celiakijos ar uždegiminių žarnyno ligų požymis, dėl kurių gydytojas greičiausiai paskirs kitus gydymo būdus.