Onkologai dažnai naudoja merkaptopuriną ūminei limfoleukemijai, paprastai vadinamai ALL, gydyti. Gydytojai taip pat gali skirti purino antagonistų vaistų, skirtų gydyti tam tikrus autoimuninius sutrikimus arba kraujo vėžį, įskaitant Chrono ligą, vaikų ne Hodžkino limfomą ir policitemiją. Nepageidaujamas poveikis koreliuoja su merkaptopurino destruktyviomis ir imunosupresinėmis savybėmis.
Ląstelių dauginimasis priklauso nuo dezoksiribonukleino rūgšties (DNR) ir ribonukleino rūgšties (RNR) kodų, esančių branduolyje, kuris paprastai lemia ląstelių susidarymo greitį ir gaminamos ląstelės tipą. Kai šie kodai sugenda, atsiranda nenormalių ląstelių arba gali paspartėti ląstelių dauginimasis. Tyrėjai mano, kad merkaptopurinas trikdo fermentų, reikalingų DNR ir RNR kodavimui, veiklą, o tai slopina nenormalų ląstelių dauginimąsi. Sustabdžius normalią ląstelių veiklą, įvyksta ląstelių sunaikinimas.
Pacientų, kuriems diagnozuota ūminė limfocitinė leukemija ir ne Hodžkino limfoma, kaulų čiulpai greitai gamina nenormalius baltuosius kraujo kūnelius. Asmenų, kuriems diagnozuota policitemija, raudonųjų kraujo kūnelių skaičius yra neįprastai didelis. Gydytojai gali skirti merkaptopurino kartu su kitais gydymo būdais, kad slopintų šių nenormalių ląstelių vystymąsi. Kai pacientai pradeda remisiją, gydytojai dažnai tęsia vaistų vartojimą, kad išvengtų anomalios ląstelių veiklos atgimimo.
Mokslininkai taip pat mano, kad merkaptopurinas trikdo chemines medžiagas, reikalingas kitiems imuniniams atsakams užtikrinti. Autoimuninėms uždegiminėms žarnyno ligoms gydyti sveikatos priežiūros paslaugų teikėjai dažnai naudoja įvairius vaistus, įskaitant priešuždegiminius vaistus ir antibiotikus. Kai Chrono liga arba opinis kolitas nereaguoja į įprastus gydymo metodus, sveikatos priežiūros paslaugų teikėjai gali skirti merkaptopurino, kad slopintų nenormalų imuninį atsaką.
Daliai pacientų, sergančių psoriaze, gali išsivystyti autoimuninis sutrikimas, vadinamas psoriaziniu artritu. Liga dažniausiai sukelia uždegimą, patinimą ir nenormalų odos, jungiamojo ir kaulinio audinio augimą. Sveikatos priežiūros paslaugų teikėjai dažnai skiria imunosupresinius vaistus, panašius į merkaptopuriną, kad sumažintų šiuos uždegiminius procesus ir slopintų ląstelių augimo defektų sankaupas.
Nepageidaujamas merkaptopurino vartojimo poveikis paprastai priklauso nuo dozės ir pacientų vartojimo trukmės. Kuo ilgiau vartojamas vaistas, tuo stipresnis šalutinis poveikis. Šalutinis poveikis yra apetito praradimas, plaukų slinkimas ir virškinimo trakto simptomai. Pacientai gali patirti pykinimą, vėmimą ir viduriavimą bei galimą žarnyno išopėjimą. Gali atsirasti anemijos požymių, nes vaistas taip pat slopina sveikų raudonųjų ir baltųjų kraujo kūnelių bei trombocitų vystymąsi.
Gydytojai taip pat gali skirti vaistų, dėl kurių šlapimas tampa labiau šarminis, ir rekomenduoti gerti mekaptopuriną su pakankamu kiekiu vandens, kad būtų išvengta galimo inkstų funkcijos sutrikimo. Problemos kyla dėl to, kad kraują filtruojantys organai susiduria su didesniu nei įprasta kiekiu sunaikintų ląstelių ir purino. Pacientai taip pat gali patirti kepenų audinio sunaikinimą po ilgo vaisto vartojimo.