Antibakteriniai produktai padeda kontroliuoti bakterines infekcijas, tačiau tyrimai parodė, kad bakterijos gali sukurti atsparumą šiems produktams, jei jų vartojama per daug arba be reikalo. Daugelis žmonių parduodami dėl idėjos juos naudoti, nes jie gali naikinti mikrobus ir bakterijas. Kai šie produktai naudojami siekiant užkirsti kelią neegzistuojančioms bakterijoms namuose, o ne naikinti jau esančias, ironiška, kad jie gali sukurti daugiau bakterijų, nei turėtų būti sumažinta.
Kai kuriose bakterijose yra genas, kuris iš prigimties yra atsparus tam tikriems antibiotikams. Todėl, užuot sunaikinę bakterijas, antibakteriniai produktai gali netgi sukelti kai kurių padermių padidėjimą. Kitos bakterijos turi ląstelių, kurios gali pašalinti antibakterinį agentą procese, vadinamame ištekėjimo siurbliu. Ląstelė priešinasi antibakteriniam poveikiui, ištuštinant ją nuo savęs.
Antibiotikai yra skirti bakterijoms naikinti, tačiau antibakteriniai produktai yra skirti tik užkirsti kelią jų plitimui. Tokie produktai yra muilas, gelis ir dezinfekavimo priemonės, taip pat buitiniai valikliai. Naudojant šiuos daiktus siekiant išvengti mikrobų, kurių nėra, problema yra ta, kad bakterijos gali mutuoti, kad atsispirtų antibakterinėms cheminėms medžiagoms.
Be to, net jei yra mikrobų ir jiems naikinti naudojamas antibakterinis muilas, dauguma žmonių plauna rankas nepakankamai ilgai arba tokioje temperatūroje, kuri reikalinga, kad muilas veiktų veiksmingai. Dažnai reikia naudoti tinkamą muilo ir vandens kiekį, o namų gaminiuose retai į tai atsižvelgiama.
Triklozanas yra pagrindinė antibakterinė medžiaga, randama antibakteriniuose produktuose, o tyrimai parodė, kad jis nepašalina visų bakterijų. Tokios antibakterinės medžiagos gali sunaikinti silpniausias bakterijas, o stipriausios bakterijos dauginasi. Dėl to galiausiai gali atsirasti „super klaidų“, kurios tampa atsparios produktams, kurie turėtų jas nužudyti.
Moksliniai tyrimai parodė bent tam tikrą ryšį tarp „per švarių“ namų, valomų antibakterinėmis priemonėmis, ir padidėjusios alergijos vaikams. Šie tyrimai rodo, kad per didelis antibakterinių medžiagų vartojimas gali paveikti imuninę sistemą, o per dažnai vartojant ant odos, gali net dažniau susirgti kai kuriomis odos ligomis. Kai kurie dermatologai pažymi, kad per daug antibakterinio muilo gali išsausinti odą, o išsausėjus odai dažnai atsiranda opos. Dėl atvirų opų oda tampa pažeidžiama bakterijų. Jei naudojamas įprastas, o ne antibakterinis muilas, problemos galima išvengti.