Nors kiaušidžių cista nėštumo metu yra gana dažna, jos paprastai negalima gydyti įprastais metodais, nes vaistai ir vaistažolių preparatai dažnai laikomi pavojingais vaisiui. Laimei, yra natūralesnių būdų skausmui gydyti ir padėti cistai išsivalyti. Geriant daug filtruoto vandens, organizmas gali susidoroti su kiaušidžių cista, o karštas kompresas gali padėti sumažinti skausmą, dažnai susijusį su šia problema. Chirurgija paprastai skirta nėštumo metu atsiradusiai kiaušidžių cistai, kuri savaime neišnyksta, ir paprastai svarstoma tik antrąjį trimestrą. Daugelis gydytojų, prieš imdamiesi kokių nors veiksmų, nori stebėti cistą.
Paprastai bet kokio nėštumo metu rekomenduojama gerti daug vandens, tačiau ypač kai yra cista. Tai gali padėti išvalyti kūną ir sumažinti spaudimą abiem kiaušidėms, kartais leidžiant cistai išnykti savaime. Tačiau rekomenduojama vengti vandens iš čiaupo ir vandens buteliuose, nes kartais gali būti nedidelis hormoninių vaistų kiekis, kuris gali pabloginti cistą. Todėl filtruotas vanduo gali būti laikomas natūraliu būdu, padedančiu išgydyti kiaušidžių cistą nėštumo metu.
Norint susidoroti su diskomfortu, kurį dažnai sukelia cistos, galima naudoti karštą kompresą, dažniausiai kaitinimo pagalvėlę arba karšto vandens buteliuką. Jis turėtų būti dedamas ant dubens, kuri dažnai yra jautriausia vieta, kai yra kiaušidžių cista. Karštą kompresą galima suvynioti į rankšluostį, kad išvengtumėte nudegimų, o tada dėti ant pilvo, kad būtų sumažintas spaudimas kiaušidėms. Ši procedūra gali nepašalinti skausmo visam laikui, tačiau ji gali padėti sumažinti diskomfortą bent jau kurį laiką laukiant, kol cista išnyks.
Kai kurios kiaušidžių cistos savaime neišnyksta, o nėštumo metu gali net išaugti. Dauguma gydytojų mėgsta atidžiai stebėti cistą ultragarsu, kad įsitikintų, jog ji yra gerybinė ir neauga, todėl gali rekomenduoti tiesiog palaukti, kol ji išnyks savaime. Kita vertus, kai kurios cistos arba auga, arba jau yra didelės, todėl jas reikia pašalinti chirurginiu būdu. Tiesą sakant, daugelis gydytojų nusprendžia pašalinti cistas, kurių skersmuo didesnis nei 2 coliai (5.1 cm), nes jos gali plyšti arba sukelti moteriai daug skausmo. Jei norint atsikratyti kiaušidžių cistos nėštumo metu reikia operacijos, gydytojai paprastai laukia antrojo nėštumo trimestro, kad sumažintų riziką tiek moteriai, tiek vaisiui.