Medicinos specialistams gali atrodyti gana logiška manyti, kad geriausias kraujo krešulio venoje ar arterijoje gydymas yra jį pašalinti chirurginiu būdu. Tai vadinama trombektomija ir daugeliui pacientų iš tikrųjų nėra geriausias gydymas. Vietoj to, trombektomija naudojama rečiau, kai reikia nedelsiant pašalinti krešulį. Paprastai vaistai, skirti suskaidyti krešulį ir skystinti kraują, o kartais ir filtro įdėjimas, kad krešulys visa forma nepatektų į kitą kūno dalį, yra laikomi pirmos eilės gydymu. Tai nereiškia, kad chirurginis krešulio pašalinimas niekada nerekomenduojamas, tačiau dauguma gydytojų tai nėra gydymas, nes tai kelia didesnę riziką.
Atliekant trombektomiją, krešulys paprastai pasiekiamas per kateterį, o po pašalinimo gali būti įdedamas stentas arba filtras. Siekiant užkirsti kelią tolesniam krešuliui šioje srityje, gali būti naudojami vaistai. Tačiau tikrasis krešulio pašalinimas gali pašalinti ir dalį kraujagyslės gleivinės, o tai kelia pavojų ateityje. Ši rizika galiausiai yra ta, kad susidarys daugiau krešulių, o tai sukelia didelių problemų asmeniui, kuriam atliekama operacija. Kai kurie patobulinti chirurginiai metodai šioje srityje dabar reklamuojami kaip puikus sprendimas, įskaitant prietaisų, kurie atlieka vakuuminį kraujo krešulio ekstrahavimą, suskaidžius jį vaistais, naudojimą; Tai rodo geresnius rezultatus nei senesni trombektomijos metodai.
Kai kuriems žmonėms šios procedūros gali prireikti dėl kitų problemų. Tiems, kurie negali ilgai vartoti kraujo skiediklių, gali prireikti chirurginio krešulio pašalinimo. Esant kritinėms situacijoms, kai žmonėms išsivysto giliųjų venų trombozė, kelianti grėsmę galūnės sveikatai arba krešulys plaučių arterijose, gali būti teikiama pirmenybė chirurginiam pašalinimui, nes tai gali pašalinti didelį pavojų sveikatai. Vis dėlto tai nėra geriausias pasirinkimas visiems žmonėms, tačiau tai gali pasikeisti, o chirurginiai patobulinimai gali tapti geresniu pasirinkimu ateityje.
Tikroji procedūra paprastai yra gana paprasta ir neužtrunka labai ilgai. Kraujagyslių chirurgai paprastai atlieka šią operaciją ir, jei viskas vyksta gerai, daugelis žmonių patenka į operacinę ir išeina iš jos per porą valandų. Juos reikės atidžiai stebėti, o kai kurie taip serga, kad prieš einant namo prireiks kelių dienų pasveikimo ligoninėje.
Kaip minėta, didelė rizika yra papildomų krešulių susidarymas. Kita galima rizika po operacijos yra insultas, kraujo krešulys, judantis plaučius, arba kraujavimas po operacijos. Rizika sumažinama naudojant stentus, antikoaguliacinį gydymą arba filtrą, o bendras pradinis šių operacijų sėkmės rodiklis yra 70% ar didesnis. Komplikacijos yra labiau tikėtinos, kai trombektomija atliekama vyresniems nei 65 metų pacientams, turintiems bet kokių kraujavimo sutrikimų arba pažengusių širdies ar inkstų ligų arba susijusių ligų, tokių kaip aukštas kraujospūdis. Esant tokiai rizikai, gydytojai turi pasverti skubios operacijos naudą, palyginti su komplikacijų tikimybe.