Dažniausios biochemijos temos paprastai skirstomos į šias kategorijas: gyvos ląstelės biochemija, medžiagų apykaita, gyvūnų ar augalų organizmai, molekulinė biochemija ir genetika. Kiekvienoje iš šių sričių biochemikai daugiausia dėmesio skiria cheminių medžiagų ir biocheminių procesų, vykstančių gyvuose organizmuose, tyrimui. Atskiros gyvos ląstelės tyrimas paprastai yra viena iš labiausiai paplitusių biochemijos temų.
Pagrindinė priežastis, dėl kurios biocheminiai tyrimai dažnai sutelkiami į atskiros ląstelės chemiją, yra ta, kad yra daugybė cheminių procesų tipų, būdingų gyvoms ląstelėms įvairiuose organizmuose, tiek gyvūnuose, tiek augaluose. Ląstelių biologija taip pat žinoma kaip citologija, o ląstelės biochemijos supratimas yra labai didelė kitų biochemijos temų dalis. Skirtingų tipų ląstelių panašumų ir skirtumų supratimas paprastai yra labai svarbus biochemikams, kurie tiria, pavyzdžiui, genetiką, medžiagų apykaitą ir įvairias gyvūnų biochemijos sritis.
Kai kurie biochemikai nori suskirstyti biochemijos temas į kategorijas pagal pagrindinę susijusią chemiją. Toks skirstymas į kategorijas gali prasidėti, pavyzdžiui, nuo pagrindinių temų apie riebalų struktūrą, baltymų struktūrą ir angliavandenių struktūrą. Kai bus suprantama pagrindinė pagrindinių molekulių, dalyvaujančių biocheminiuose procesuose, struktūra, pažangesnis tyrimas gali paaiškinti funkcijas, kurias skirtingos molekulės paprastai atlieka gyvoje ląstelėje.
Funkcinės biochemijos temos galėtų tęstis po struktūrinės biochemijos ar molekulinės biologijos temų. Tai gali apimti tokius dalykus kaip surišimas arba kaip skirtingos molekulės sąveikauja viena su kita; transportą, ty kaip molekulės juda į gyvas ląsteles ir iš jų; kinetika arba cheminės transformacijos; ir signalizacija, arba kaip gyvos ląstelės bendrauja viena su kita. Tikėtina, kad šiuo keliu studijuojantis biochemikas įgis gerą pagrindinį biochemijos pagrindą, kuris vėliau gali būti panaudotas įvairioms biochemijos karjeros specialybėms.
Biochemijos laboratorijoje tiriamos įvairios temos gali būti labai įvairios. Supratimas apie pagrindinius gyvenimo elementus, atskiras gyvas ląsteles, sudaro daugelio, jei ne visų, biochemijos darbo galimybių pagrindą ir gali būti laikomas pagrindiniu biochemijos karjeros pradžios tašku. Kalbant apie biochemijos temas, biochemija, molekulinė biologija ir kitos biologijos studijų sritys taip pat labai sutampa.