Antikūnų surišimas vyksta imuninio atsako tarp antikūnų ir specifinių antigenų metu. Antigenai yra bet kokios ląstelės ar molekulės, kurias organizmas atpažįsta kaip svetimas arba nepriklausomas sau. Antigenai gali būti įvairių formų – nuo ligas sukeliančių organizmų, tokių kaip bakterijos ir virusai, iki toksiškų molekulių ar alergiją sukeliančių molekulių, alergenų. Antigenų buvimas organizme stimuliuoja imuninės sistemos ląsteles, įskaitant tas, kurios gamina ir išskiria antikūnus.
Antikūnai yra baltymai, turintys išskirtinę bazinę struktūrą. Jie sudaryti iš keturių polipeptidinių grandinių, kurias kartu laiko disulfidiniai tilteliai, kurie yra ryšiai, susidarantys tarp sieros atomų. Kiekvienas antikūnas turi dvi ilgas arba sunkias grandines ir dvi trumpas arba lengvas grandines. Kiekviena lengvoji grandinė randama vienos iš sunkiųjų grandinių gale. Keturios grandinės laikomos kartu Y formos, kuri suteikia lankstumo, todėl gali įvykti antikūnų surišimas.
Kiekvienas antikūnas yra specifinis tam tikram antigenui. Antikūno specifiškumas nustatomas pagal antigeno surišimo vietą, esančią kiekvienos lengvosios grandinės gale. Kiekvienos lengvosios grandinės gale randama aminorūgščių seka sudaro trimatę formą, kuri papildo antigeno formą. Kadangi kiekvienam antikūnui yra dvi lengvosios grandinės, yra dvi antigeno surišimo vietos, todėl kiekvienas antikūnas gali prisijungti prie dviejų antigenų.
Yra penkios skirtingos antikūnų klasės. Kadangi jie visi yra rutuliniai baltymai, gaminami kaip imuninio atsako dalis, jie vadinami imunoglobulinais, kurių kiekviena klasė žymima raidėmis G, M, A, D ir E. Nors visi imunoglobulinai turi tą pačią pagrindinę struktūrą, skirtingos klasės yra remiantis sunkiųjų grandinių skirtumais. Kiekvienoje klasėje gali būti daug skirtingų antikūnų, kurių specifinis antikūnų jungimasis vyksta tarp konkrečios molekulės ir ją papildančio antigeno.
Kiekviena iš skirtingų antikūnų klasių jungiasi su skirtingų tipų antigenais ir atlieka skirtingą vaidmenį imuninėje sistemoje. Pavyzdžiui, imunoglobulinas G, IgG, gali prisijungti prie dviejų antigenų, stimuliuoja kitas imuninės sistemos ląsteles ir gali sukelti agliutinaciją. Agliutinacija įvyksta, kai antikūnai jungiasi tarp kelių antikūnų ir antigenų. Taip gali nutikti, kai antigenas taip pat turi daugiau nei vieną surišimo vietą, todėl jis gali prisijungti prie daugiau nei vieno antikūno. Kadangi vis daugiau antikūnų ir antigenų jungiasi kartu, jie sudaro gumulą arba agliutinatą, kuris padeda sunaikinti ląsteles su antigenais.