Masės spektrometras yra prietaisas, dažnai naudojamas molekulių masei matuoti, kuris gali padėti identifikuoti mėginyje esančius junginius. Įkrautos dalelės, vadinamos jonais, išleidžiamos iš mėginio ir analizuojamos. Prietaisas su keliais analizatoriais vadinamas tandeminiu masės spektrometru (MS/MS). Paprastai jis gali suskaidyti molekules ir jonus, todėl dažnai naudojamas identifikuoti baltymus ir kitas organines medžiagas. Prietaisas gali turėti vieno tipo spektrometrus arba sujungti kelis iš jų; Kartais įmontuojami du, trys arba keturi analizatoriai.
Vienos rūšies molekulės ar baltymai gali būti išskiriami naudojant magnetinį lauką tandeminiame masės spektrometre. Tam galima naudoti pirmąjį analizatorių. Prieš molekules veikiant dujomis, jonai dažnai stabilizuojami antruoju analizatoriumi. Dėl susidūrimų molekuliniame lygmenyje dalelės skyla į fragmentus, kuriuos aptinka trečiasis analizatorius. Nors yra keletas molekulių suskaidymo metodų, kartais galima naudoti vieną analizatorių su kvadrupolio jonų gaudykle, kuri veikia jonus į elektrinius laukus ir išstumia juos iš radijo dažnio lauko.
Tandeminio masės spektrometro detektorius paprastai seka jonų aktyvumą. Tada sukuriamas signalas, kuris siunčiamas į kompiuterinę sistemą, kuri saugo duomenis. Grafinis grafikas paprastai naudojamas norint nurodyti, kas yra mėginyje ir kokia yra kiekvienos medžiagos molekulinė masė. Grafikas taip pat gali parodyti kiekvienos rūšies molekulės ar baltymo kiekį mėginyje. Yra įvairių tipų detektoriai, kuriuos galima naudoti MS/MS, įskaitant fotodaugiklius, skirtus elektromagnetinei energijai aptikti, arba elektronų daugiklius, kurie yra vakuuminiai vamzdžiai, kurie susiduria su elektronais, kad sustiprintų srovę.
Su tandeminiu masės spektrometru galima atlikti įvairių tipų eksperimentus. Įprastas yra vienos masės stebėjimas, kai pirmasis analizatorius leidžia perskaityti dalelių tipą, o antrasis ieško konkretaus fragmento. Kelių reakcijų stebėjimas apima skirtingų tipų jonų fragmentų sekimą antruoju analizatoriumi. Jie abu dažnai naudojami farmacijos tyrimuose, o pirmtakų jonų skenavimo eksperimentai paprastai padeda aptikti jonų nuostolius ir aptikti nežinomus molekulinius komponentus.
Tandeminis masės spektrometras taip pat gali būti naudojamas kaip medžiagų apykaitos patikros įrankis. Jis buvo naudojamas naujagimių sutrikimams, susijusiems su baltymais, vadinamais aminorūgštimis, nustatyti. Kraujo, skydliaukės ir medžiagų apykaitos būkles galima nustatyti laboratorijose analizuojant kraujo mėginius su MS/MS.