Paruošiant mėginį medžiaga paruošiama analizei naudojant tokią įrangą kaip chromatografas, kurią galima naudoti junginio kiekiui nustatyti. Neapdorotų mėginių paprastai negalima tiesiogiai įterpti į mokslinę įrangą, nes juose yra priemaišų arba jie yra tokios formos, kurios įranga negali lengvai interpretuoti. Jie turi būti kruopščiai tvarkomi ir paruošti, kad būtų paruošti bandymui kontroliuojamomis sąlygomis, kad būtų sumažinta klaidų tikimybė. Galima naudoti daugybę skirtingų metodų, skirtų naudoti su įvairių rūšių pavyzdžiais.
Technikai pradeda nuo neapdoroto mėginio, kurį jie galėjo surinkti arba gauti analizei. Jie nustato, kokią mėginio paruošimo techniką naudoti, įvertinę medžiagos pobūdį ir nusprendę, kokius tyrimus jie nori naudoti. Mėginį gali tekti koncentruoti, nes dominanti medžiaga yra labai atskiesta arba apdorota, kad būtų pašalinti teršalai, galintys trukdyti tyrimui. Mėginio paruošimas gali apimti filtravimą, tirpinimą, šlifavimą ir kitus veiksmus, kad mėginys būtų konvertuojamas į formatą, kurį būtų galima nuskaityti įrangoje.
Pavyzdžiui, technikas gali norėti naudoti dalinį mėginių ėmimą ruošdamas mėginį. Tai leidžia išbandyti nedidelį pradinio mėginio komponentą, kad jį būtų galima išsaugoti, kad jį būtų galima naudoti pakartotiniuose arba skirtinguose bandymuose. Svarbu gauti reprezentatyvų mėginį, kad būtų išvengta netikslių rezultatų, todėl mėginį reikia atsargiai tvarkyti, kad būtų galima išgauti gerą pavyzdį analizei.
Ruošiant mėginį reikia atidžiai kontroliuoti darbo sąlygas. Viskas, kas įtraukta į mėginį, turi būti žinoma, kad technikas išvengtų atsitiktinio užteršimo. Pavyzdžiui, jei cheminę medžiagą reikia atlikti cheminėje reakcijoje, kad ją būtų galima perskaityti moksliniame prietaise, technikas turi naudoti tinkamą reaktyviąją medžiagą. Visi naudojami konteineriai ir įranga turi būti švarūs, o aplinka ant stalo turi būti skaidri, kad nesusimaišytų konteineriai ir metodai.
Atskiros laboratorijos gali turėti savo mėginių paruošimo protokolą. Laboratorijos vadove aptariami galimi metodai ir pateikiamos rekomendacijos, kaip tvarkyti konkrečias dominančias medžiagas. Šie dokumentai gali padidinti bandymų nuoseklumą ir užtikrinti, kad nesvarbu, kuris technikas atlieka bandymą, mėginys bus tvarkomas taip pat. Laboratorijos klientai gali paprašyti dokumentų, kad įsitikintų, jog tyrimai atliekami tinkamai; Pavyzdžiui, laboratorija, kuri tiria sportininkų mėginius, kad patikrintų, ar nėra dopingo, turėtų tai daryti vadovaudamasi vadovaujančios institucijos rekomendacijomis, kad jos rezultatai būtų galiojantys.