Biologinis karas, dar vadinamas gemalų karu, yra žalingų mikroorganizmų, tokių kaip virusai ar bakterijos, panaudojimas karinių grupuočių ar teroristų prieš civilius, priešingus karius, pasėlius ar gyvūnus. Naudojami organizmai gali gaminti kenksmingus nuodus ar toksinus prieš arba po jų išsiuntimo. Gali būti, kad nebūtina paleisti didelio kiekio biologinio ginklo, nes kai kurių tipų mirtini agentai gali nužudyti net milijonus žmonių, išleisdami tik pėdsakus.
Biologinį karą įvairiais būdais gali panaudoti karinė apranga ar kiti žalingų ketinimų turintys žmonės. Labiausiai paplitęs supratimas apie biologinių agentų naudojimą yra tas, kad jie skirti nužudyti didžiulius kiekius kareivių ir civilių, tačiau yra daug būdų, kaip juos panaudoti. Mažiau kenksmingi mikrobai gali būti paskirstyti tarp priešo kareivių, kad jie būtų per daug sergantys kovai. Kitas veiksmingas mikroorganizmų panaudojimas yra jų naudojimas priešo maisto pasėliams nužudyti arba sugadinti, siekiant nutraukti maisto tiekimą, įskaitant gyvulius ir pagrindinius augalinės kilmės maisto produktus.
1969 metais JAV buvęs JAV prezidentas Richardas M. Nixonas pareiškė, kad šalis nebenaudos biologinio karo prieš kitas šalis. Tokio tipo kovos buvo uždraustos tarptautine sutartimi 1975 m., be to, jos apima ir biologinių ginklų laikymą bei gamybą. Tačiau karo strategai iki šiol turi atsižvelgti į galimą priešo neteisėtą biologinio karo panaudojimą. Dėl šios priežasties visame mokslo pasaulyje nuolat atliekami tyrimai, skirti apsisaugoti nuo daugybės biologinių atakų scenarijų. Tai apima teroristinius išpuolius, dar vadinamus bioterorizmu, kurie gali įvykti bet kur ir bet kada.
Kad biologinis ginklas būtų veiksmingas, jis turi sugebėti greitai ir plačiu plotu keliauti. Tai taip pat turi būti sunku ištaisyti. Pavyzdžiui, jei tai liga, vakcina turi būti sunkiai prieinama arba jos nebūti. Juodligė yra biologinio karo rūšis, kuri, tinkamai pagaminta, gali išplisti oru didelėje teritorijoje ir gana greitai užkrėsti taikinį. Kadangi juodligės poveikis žmonėms ar gyvūnams nėra perduodamas įprastomis priemonėmis, tokiomis kaip kvėpavimas, juodligė gali būti lengvai apribota tikslinėje srityje. Tačiau ši sritis gali būti labai didelė ir išliks užteršta ilgą laiką po to, kai ginklas bus paleistas dėl padidėjusio teršalo, kuris buvo pagamintas specialiai kaip biologinis ginklas, stiprumo.
Kiti agentai, kurie buvo naudojami arba suplanuoti kaip biologinis karas prieš žmones, yra cholera, raupai ir geltonoji karštinė, kad būtų galima paminėti tik keletą. Kadangi yra tiek daug veislių, tie, kurie rūpinasi gynyba nuo biologinių atakų, turi būti pasirengę kuo greičiau identifikuoti mikrobų ar toksinų tipą įvairiais metodais. Biologinio ginklo gaminami toksinai ir nuodai dažnai taip pat laikomi cheminio karo rūšimis. Yra daug tyrimų, kurie vienu metu atliekami tiek biologinio, tiek cheminio karo srityse, nes jie gali būti taip glaudžiai tarpusavyje susiję.