Lyginamasis mikroskopas susideda iš dviejų atskirų mikroskopų, sujungtų kartu ir yra naudojamas dviejų objektų ar mėginių palyginimui. Įrenginio tipas, vadinamas optiniu tilteliu, leidžia vartotojui peržiūrėti abu pavyzdžius vienu metu. Šio tipo mikroskopai yra svarbūs teisėsaugai – kriminalinės ekspertizės ir balistinės analizės srityse. Tai leidžia tarpusavyje palyginti kulkas ir kulkų fragmentus, taip pat kitus teismo ekspertizės įrodymus, kurie gali būti naudojami kaltei įrodyti arba įtariamajam kai kuriais nusikaltimais atleisti.
Mikroskopas yra vienas svarbiausių išradimų žmonijos istorijoje. Tai leido tobulėti daugeliui mokslų ir pakeitė daugelį mūsų idėjų apie beveik kiekvieną fizinį mokslą ir netgi paskatino kurti naujus mokslus. Idėja sujungti du mikroskopus, kad vienu metu būtų galima tirti du mėginius, buvo tik jau gerai išvystytų technologijų, naudojamų standartiniams mikroskopams kurti, išplėtimas. Ankstyvojo palyginimo mikroskopo optinis tiltelis buvo ne kas kita, kaip dvi poros veidrodžių, po vieną kiekvienam mikroskopui, nukreipiančių atskirus vaizdus į vieną žiūrovą, sukuriant abiejų mėginių vaizdą viename vaizde.
Šio naujo tipo mikroskopo išradimas paskatino daugelio mokslo disciplinų, ypač balistikos ir kriminalinės ekspertizės, pažangą. Galimybė tirti ir palyginti du pavyzdžius greta leido teigiamai nustatyti, ar dvi kulkos buvo paleistos iš vieno ginklo, ar iš skirtingų ginklų. Naudojant bandomąją kulką kaip valdiklį, taip pat buvo galima nustatyti, ar konkreti kulka buvo paleista iš tam tikro ginklo, ar ne.
Po jo išradimo lyginamąjį mikroskopą kriminalistikoje panaudota daug kitų. Beveik bet kokios medžiagos pavyzdžius galima palyginti, kad būtų galima nustatyti perdavimo ar atsekti įrodymus. Taip galima palyginti ir plaukų pavyzdžius bei pirštų atspaudus. Taip pat galima palyginti rašysenos pavyzdžius ir biologinius mėginius, tokius kaip bakterijos ir dumbliai. Įrankių žymes galima palyginti, kad būtų galima nustatyti, kokie įrankiai buvo panaudoti objekte, arba suderinti orientacinį įrankį su žinomu nusikaltimo metu naudotu įrankiu.
Šiuolaikinės technologijos daug patobulino pagrindinį palyginamąjį mikroskopą. Kompiuteriai ir šviesolaidžiai leidžia vaizdus rodyti monitoriuose arba projekciniuose ekranuose ir uždėti vienas ant kito. Palyginamajame mikroskope gali būti daug parinkčių, pvz., apšvietimas, padidinimo laipsniai ir galimybė daryti pavyzdžių palyginimo nuotraukas.