Tyrimo programa koordinuoja kelis projektus, kurie turi bendrą tyrimo tikslą. Tokioms programoms paprastai vadovauja ir finansuoja didelės organizacijos, tokios kaip universitetai, korporacijos, NVO ir vyriausybės. Priklausomai nuo organizacijos poreikių ir interesų, tyrimų programos labai skiriasi tiek savo struktūromis, tiek tikslais.
Mokslinių tyrimų programų vadovai pirmiausia stengiasi koordinuoti ir prižiūrėti visus susijusius projektus ir užtikrinti, kad jie tęstų savo užduotis. Remiami projektai paprastai taip pat turės savo tiesioginius vadovus. Šis asmuo paprastai yra atsakingas už konkretaus projekto sukūrimą ir įgyvendinimą.
Daugeliu atvejų ryšys tarp tyrimų programos ir tyrimo projekto gali būti panašus į ryšį tarp franšizės davėjo ir franšizės gavėjo. Franšizės davėjas pateikia nusistovėjusias gaires ir paramos sistemą, o franšizės gavėjas stengiasi plėtoti savo konkretų verslą. Kaip ir franšizės sistemoje, bendra tyrimų programos sėkmė priklauso nuo mažesnių jos sudedamųjų dalių sėkmės. Projektų vadovai gali bendrauti vieni su kitais, kai vieno projekto sėkmingas veikimas priklauso nuo kito projekto, arba gali vykdyti savo veiklą labiau savarankiškai. Bet kuriuo atveju visi projektai yra atskaitingi priežiūros programai ir jos tikslams.
Įvairių tipų organizacijos, rengdamos naujas mokslinių tyrimų programas, turi skirtingus tikslus. Pelno siekianti įmonė gali pradėti tyrimų programą, kad sužinotų daugiau apie savo rinką, konkurenciją ir produktų ar paslaugų kūrimo galimybes. Šios mokslinių tyrimų programos skirtos atrasti rinkos poreikius, rasti būdų, kaip geriau patenkinti šiuos poreikius ir apskritai tapti konkurencingesniems. Įmonių tyrimų programos taip pat dažnai kuriamos siekiant ištirti išlaidas ir išlaidas, įtraukti naujas technologijas ir organizacines priemones ir pasirengti dideliems darbams, pavyzdžiui, inžineriniam projektui. Įmonė taip pat gali kurti mokslinių tyrimų programas, skirtas socialiniams tikslams remti – jos gali būti skirtos pagalbai aplinkinei bendruomenei arba pačios įmonės darbuotojams.
Socialinės krypties mokslinių tyrimų programas taip pat dažnai inicijuoja NVO ir vyriausybės. Jie gali būti skirti ekonominiam ar politiniam vystymuisi, paslaugų, tokių kaip švietimas ar sveikatos apsauga, gerinimas, piliečių verslumo skatinimas, aplinkos apsauga, naujokų integravimas į visuomenę arba daugybė organizacijos užsibrėžtų tikslų. Vyriausybės taip pat dažnai finansuoja mokslinių tyrimų programas, skatinančias augimą tam tikrose pramonės šakose. Universitetas kartais gali sutelkti dėmesį į mokslinius tyrimus dėl savęs, tai yra, siekdamas tobulinti žmogaus žinias. Tarporganizacinis finansavimas ir bendradarbiavimas mokslinių tyrimų projektuose taip pat gali atsirasti ten, kur interesai sutampa.