Epilepsijos kolonija yra gyvenamoji įstaiga, skirta epilepsijos pacientų gydymo poreikiams patenkinti. Tokios vietos istoriškai buvo naudojamos epileptikams ir psichikos ligoniams atskirti nuo likusios visuomenės, atspindinčios plačiai paplitusią epilepsijos ir psichinių ligų baimę. Šiuolaikinėse įstaigose terminas „epilepsijos kolonija“ paprastai nevartojamas ir gali būti skiriamas stacionariniam ir ambulatoriniam įvairių neurologinių ligų, ne tik epilepsijos, gydymui.
Panašu, kad ankstyviausia epilepsijos kolonija buvo įkurta Bylefelde, Vokietijoje, XX a. praeito amžiaus dešimtmetyje, maždaug tuo pačiu metu, kai eugenikos judėjimas apėmė Europos bendruomenę. Tai nėra paprastas sutapimas; eugenika yra socialinis judėjimas, apimantis selektyvų žmonių rasės veisimąsi, siekiant skatinti norimus bruožus. Epilepikų izoliacija neabejotinai buvo skirta pašalinti epilepsiją iš genofondo, o kai JAV buvo priimta ši koncepcija, kai kurios įstaigos netgi sterilizavo savo kalinius, užtikrindamos, kad jie negalėtų daugintis.
Istoriškai epilepsijos kolonijos buvo nudažytos kaip malonios patalpos, skirtos nesavanaudiškai pacientų priežiūrai. Patalpos dažnai buvo skirstomos į „pagydomas“, „nepagydomas“ ir „smurtaujančias“ palatas, o pacientai tariamai turėjo galimybę gauti aukščiausios klasės medicininę priežiūrą, fizinę terapiją, poilsį ir pan. Tiesą sakant, epilepsijos kolonija dažnai buvo labai niūri vieta, sukurta labiau kaip kalėjimas, o ne gyvenamoji gydymo įstaiga, ir daugelis žmonių tokiose kolonijose turėjo kitų ligų, nei epilepsija, kurios nebuvo gydomos.
Epilepsijos kolonijos dažnai puikavosi pacientų „laukiančiųjų sąrašais“, nors iš tikrųjų daugelis pacientų buvo priversti persikelti į koloniją šeimos narių ar jų praktikų. Kai kurios šeimos nusprendė siųsti sergančius giminaičius į epilepsijos koloniją, nes tikėjo, kad šeimos narys gali pagerinti medicininę priežiūrą, o kitos tiesiog išmetė tokius giminaičius, nenorėdami susidoroti su savo negalia. Bet kuriuo atveju, patekus į epilepsijos koloniją, paprastai buvo sunku išeiti. Kiti manė, kad epilepsija sergantys artimieji gali jaustis patogiau kitų, sergančių epilepsija, kompanijoje.
Pradėjus mažėti eugenikos populiarumui, mažėjo ir epilepsijos kolonija. Daugelis tokių kolonijų buvo uždarytos dar XX amžiaus 1920-ajame dešimtmetyje, o kitos išnyko iš kraštovaizdžio dar šeštajame ir šeštajame dešimtmetyje. Vis dėlto, kai idėja apriboti epilepsijos ligonius prarado populiarumą, daugelis įstaigų ir toliau rūpinosi psichikos ligoniais, iki pat devintojo dešimtmečio, kai JAV buvo uždaryta dauguma valstybinių psichikos ligoninių.
Šiandien epileptikai ir psichikos ligomis sergantys žmonės turi daugybę gydymo galimybių, kai kurios iš jų gali apimti buvimą stacionarinėse įstaigose. Tačiau tokių įstaigų sąlygos kardinaliai skiriasi nuo istorinių epilepsijos kolonijų, kuriose dirba profesionalūs, jautrūs darbuotojai, kuriems labai rūpi pacientų gerovė.