Migdolinis kūnas, taip pavadintas, nes primena migdolą, yra smegenyse esančių branduolių rinkinys, esantis arti vienas kito ir todėl sugrupuotas tuo pačiu pavadinimu. Tarp ryškiausių yra bazolaterinis kompleksas, centromedialinis branduolys ir žievės branduolys. Migdolinis kūnas yra limbinės sistemos dalis, atsakinga už emocijų reguliavimą. Jis dažniausiai siejamas su baimės ir nerimo emocijomis, o jo dydis teigiamai koreliuoja su tam tikros rūšies agresijos lygiu. Jis taip pat siejamas su malonumo emocija, nors daugiausia neigiama prasme, ty malonumu, kartais būdingu agresijai.
Yra dvi migdolinės dalys, simetriškai išsidėsčiusios netoli smegenų centro, tiesiai virš pagumburio. Kiekvienas iš jų yra maždaug 1 colio (2.54 cm) ilgio. Ši struktūra pastaraisiais dešimtmečiais sulaukė daug dėmesio ir buvo daugelio mokslinių tyrimų projektų dėmesio centre.
Migdolinis kūnas atlieka pagrindinį vaidmenį vadinamajame „bendros paskirties gynybos atsako valdymo tinkle“ ir reaguoja į nemalonius reginius, pojūčius ar kvapus. Pyktis, vengimas ir gynyba yra emocijos, kurias daugiausia suaktyvina ši smegenų dalis. Jo evoliucinė kilmė slypi ankstyvosiose žuvyse ir turi tiesioginių ryšių su viena seniausių jutimo sričių – uoslės lempute. Migdolinis kūnas yra atsakingas už protėvių nelaimės požymių, tokių kaip „įtempta burna“, ir gynybines pozas, tokias kaip tupėjimas, aktyvavimą.
Kaip ir daugelis limbinės sistemos dalių, migdolinio kūno funkcionavimas nėra susijęs tik su kokia nors viena emocija. Prasta amygdalinė veikla siejama su nerimu, autizmu, depresija, narkolepsija, potrauminio streso sutrikimu, fobijomis ir šizofrenija. Pažeidimų tyrimai su beždžionėmis parodė, kad kai ši struktūra sutrinka iki šešių mėnesių amžiaus, individams sunku prisitaikyti prie socialinio gyvenimo. Taip yra todėl, kad migdolinis kūnas reikalingas ne tik norint patirti emocijas, tokias kaip baimė, bet ir modeliuoti bei greitai atpažinti šių emocijų buvimą kituose. Taigi pažeistas asmuo buvo siejamas su autizmo būkle arba socialiniu aklumu.
Žmonėms migdolinis kūnas yra smegenų struktūra, kuri labiausiai skiriasi tarp lyčių. Kastruojant patinus, jo dydis sumažėja 30%. Depresija buvo siejama su asimetriniais migdolų dydžiais.