Funkcinė organizacinė struktūra yra įmonės organizavimo būdas, pagrįstas skyriumi, kuriam priklauso ir asmuo ar grupė. Tai viena iš trijų didžiųjų organizacinių struktūrų, kitos dvi yra paprastos ir padalintos. Turėdamas funkcinę organizacinę struktūrą, verslas turi vertikalią hierarchiją ir horizontalius lygius. Paprastai atsakingas yra vienas asmuo, po kurio eina įvairių skyrių vadovai. Po jais yra palaipsniui žemesni hierarchijos sluoksniai. Skyriai yra vertikalūs po skyriaus vadovu, tačiau horizontalūs su kitais įmonės padaliniais.
Įmonėje organizacinė struktūra leidžia žmonėms tiksliai žinoti, kas kam vadovauja ir kokios yra konkretaus asmens pareigos. Šis aiškus užduočių apibrėžimas leidžia didelėms žmonių grupėms bendrauti tarpusavyje nesijaudinant dėl pozicijų ir rango. Yra trys pagrindiniai verslo organizavimo būdai.
Paprasta organizacinė struktūra yra įprasta mažose įmonėse, kuriose nėra daug darbuotojų. Vienas žmogus yra viršuje, o po juo yra vienas asmuo arba nedidelė grupė. Šis antrasis lygis yra organizacijos vadovai ir visi jie yra maždaug vienodi. Retkarčiais atsiranda grupė vadovų padėjėjų, tačiau paprasta struktūra dažnai pereina į paskutinį lygmenį – paprasti darbuotojai. Visi kiti organizacijoje yra vienoje grupėje ir niekas neturi daugiau ar mažiau galios nei bet kuri kita.
Padalinių organizacinės struktūros suskaidomos atsižvelgiant į projektus, su kuriais dirba žmonės. Vėlgi, verslui vadovauja vienas žmogus, o po jo – projektų vadovai. Šie žmonės organizuoja ir struktūrizuoja įmonių projektus. Pagal juos paeiliui yra žemesnės grupės, kurios dirba su tuo pačiu projektu. Bet kuriame lygyje gali būti grupė, kurią sudaro inžinierius, rinkodaros specialistas ir techninis rašytojas. Tarp skirtingų projektų grupių nėra šoninės koreliacijos.
Funkcinė organizacinė struktūra skaido dalykus pagal padalinius, o ne pagal užduotis. Grupei vadovauja žmonės, kurie vien tik prižiūri vieną sritį. Pavyzdžiui, rinkodaros viceprezidentas nerimauja tik dėl rinkodaros problemų, o visi žemiau esantys lygiai atlieka tik rinkodarą. Skirtingai nuo padalintos organizacijos, funkcinė organizacinė struktūra turi šoninius ryšius. Skyrius, esantis trimis laipteliais žemiau rinkodaros vadovo, yra maždaug toks pat, kaip ir trys laipteliai žemiau tyrimų ir plėtros vadovo.
Funkcinės organizacinės struktūros pranašumas prieš kitas iš esmės atsiranda dėl talentų sutelkimo vienoje vietoje. Pavyzdžiui, turėdamas visus rinkodaros žmones vienoje srityje, skyrius gali sugalvoti idėjų, kurių asmenys gali patys neturėti. Tai taip pat yra pagrindinis trūkumas. Kadangi bet kuriame skyriuje yra tik viena grupė, jos žinios apie kitus yra ribotos.