Mišri ekonomika yra vyriausybės kontroliuojamos ir laisvosios rinkos ekonomikos mišinys, ir nors kai kurie gali manyti, kad ši ekonomika yra ideali, ji turi trūkumų. Vienas iš mišrios ekonomikos trūkumų yra tai, kad verslo savininkai turi mokėti mokesčius, kurių negali kontroliuoti, nes vyriausybė kontroliuoja mokesčių surinkimą ir išlaidas. Valdžia linkusi išteklius skirti socialinei gerovei, o ne ekonomiką skatinantiems daiktams. Ši ekonomika verslo savininkams suteikia didelę laisvę, tačiau kai kuriems tai gali būti problema, nes verslo savininkai turi rasti savo rinką. Vyriausybė taip pat turi didelę įtaką ekonomikoje, todėl verslo savininkams paprastai tenka daug popierizmo ir biurokratijos.
Verslo savininkai retai mėgsta mokėti mokesčius, nes tai įkanda jų pelnui. Tai yra vienas iš mišrios ekonomikos trūkumų, nes vyriausybė yra įtraukta į ekonomiką. Verslo savininkai taip pat negali nustatyti, kur nukeliauja jų mokesčių pinigai. Vietoj to, vyriausybė paima iš anksto nustatytą procentą iš verslo savininkų pelno ir naudoja pinigus taip, kaip nori; tai reiškia, kad pinigai galėtų būti panaudoti socialinėms programoms ar karams.
Vyriausybė kontroliuoja išteklių paskirstymą mišrioje ekonomikoje. Laisvosios rinkos ekonomikoje ištekliai bus skiriami paslaugoms, kurios geriausiai skatina ekonomiką, tačiau mišri ekonomika didžioji dalis išteklių skiriama socialinės gerovės programoms. Nors kai kurie žmonės tai vertins kaip privalumą, verslo savininkams tai yra trūkumas, nes jie gali neturėti pakankamai išteklių sukurti tinkamą produktą ar pelną.
Kitas trūkumas yra verslo savininkų laisvė kuriant produktą. Nors kai kuriems gaminių tipams taikomi teisiniai apribojimai, daugumą gaminių galima pagaminti be jokių tokių problemų. Tai reiškia, kad verslo savininkai turi rasti ir sukurti savo rinką, o tai kai kurioms įmonėms gali būti sudėtinga dėl mišrios ekonomikos laisvosios rinkos pusės.
Vyriausybinės agentūros paprastai mėgsta sekti verslą, jų pajamas ir daugelį kitų verslo praktikos aspektų. Tai reiškia, kad verslo savininkams gali tekti susitvarkyti su daugybe dokumentų ir biurokratijos, kad gautų licencijas ar tiesiog veiktų legaliai. Tai vienas iš mišrios ekonomikos trūkumų, kuris privačiam verslui yra sunkiausias, nes jie dažnai patiria daugiausiai popierizmo.