Žmogaus kūno virškinimo sistema ir homeostazė yra neatsiejamai susijusios, nes žmonės yra praryjantys heterotrofai, o tai reiškia, kad organizmas turi turėti mechanizmą, pagal kurį būtų įsisavinamas išorinis mitybos šaltinis. Kad virškinimo sistema ir homeostazės reguliavimas būtų sėkmingas, reikia gryninti ir suvalgyti esmines valgomų maisto produktų maistines medžiagas, o prireikus taisyti ir papildyti virškinimo sistemos struktūros „susidėvėjimą“. Be to, kiekviena kūno sistema priklauso nuo maistinių medžiagų suskaidymo ir įsisavinimo, kad audiniai būtų atstatyti, sukurti ir palaikyti. Už virškinimo sistemos homeostazę atsakinga daugybė cheminių, mechaninių ir fermentinių procesų.
Virškinimą atlieka kūnas, kai maistas juda per kūną konvejerine organų sistema, kuri suskaido maistą į organizmo ląstelėms priimtiną kurą. Procesas prasideda burnoje, kai fermentai pirmą kartą patenka per seiles. Viena iš palankiausių virškinimo sistemos ir homeostazės sąsajų yra vandenilio (pH) balanso potencialo palaikymas virškinimo trakte. Homeostazė virškinamajame trakte pasiekiama dėl organizmo gebėjimo dramatiškai pakeisti pH nuo seilių, kurios yra tik šiek tiek rūgštus, į labai rūgštinę skrandžio terpę, kuri greitai skaido maistą ir apsaugo organizmą nuo bakterijų ir kitų ligų sukėlėjų. Dar dramatiškesnis yra pH pokytis į žymiai bazinę aplinką plonojoje žarnoje, kurios reikia, kad žarnynui būdingi fermentai tinkamai veiktų.
Kitas svarbus ryšys tarp virškinimo sistemos ir homeostazės organizme yra svetingos atmosferos naudingoms bakterijoms palaikymas. PH reguliavimas kartu su kitais veiksniais, pvz., subalansuoto fermentų santykio palaikymu, leidžia naudingai žarnyno florai, tokiai kaip acidophilus ir bifidobakterijos, padėti organizmui kovoti su mažiau pageidaujamomis bakterijų kolonijomis, kurios gali sukelti potencialiai gyvybei pavojingą infekciją ir ligas. Naudingos bakterijos gali suskaidyti kai kuriuos kancerogenus ir vaistų metabolitus, kurie, kaip įrodyta, sukelia vėžį – ligą, kuri plinta smarkiai pablogėjus bendrai homeostatinei būklei organizme. Naudingos bakterijos taip pat gamina vitaminą K ir kitas įvairias biologines medžiagas, kurių organizmas pats nepajėgia pasigaminti.
Dauguma sveikatos priežiūros specialistų mano, kad tinkama fermentų, bakterijų ir pH pusiausvyra yra pagrindinis ryšys tarp virškinimo sistemos ir homeostazės. Pacientai, kurie pasirenka gyvenimo būdą, skatinantį šias sąlygas, greičiausiai išlaikys sveiką kūno svorį ir bus gerai maitinami. Jie rečiau serga sunkiomis ligomis, tokiomis kaip vėžys ir diabetas.