Giliai smegenų centre esantys kairieji ir dešinieji baziniai ganglijai juosia talamus ir sudaro svarbią priekinių smegenų dalį. Manoma, kad šių ganglijų struktūra ir funkcija yra simetriški. Nors žinių apie smegenų sutrikimus, turinčius įtakos kairiajam baziniam ganglijai, yra daug, galutinės, nuoseklios teorijos apie jo funkciją dar reikia sukurti. Manoma, kad ši smegenų sritis yra susijusi su vykdomosiomis funkcijomis, mokymusi ir emocijomis. Eksperimentiniai tyrimai parodė, kad šios ganglijos yra susijusios su aktyvumo parinkimu, aktyvumo perjungimu ir judėjimu, tačiau lieka neaišku, kaip ji panaudoja savo slopinamąjį aktyvumą motoriniams neuronams suaktyvinti.
Dažniausiai pasitaikantys sutrikimai, paveikiantys kairįjį bazinį gangliją, yra Hantingtono ir Parkinsono liga. Abiem šioms sąlygoms būdingi judėjimo sutrikimai, taip pat pažinimo lankstumo ir vykdomosios funkcijos sumažėjimas. Tai patvirtina teoriją, kad šis smegenų regionas yra atsakingas už įvairias ir sudėtingas užduotis smegenyse.
Tourette sindromas ir obsesinis-kompulsinis sutrikimas taip pat buvo susiję su kairiojo bazinių ganglijų disfunkcija. Tai nenuostabu, nes daugelis neurologų įtaria, kad veiklos perjungimas ir pasirinkimas taip pat gali būti susijęs su šia smegenų dalimi. Išvados, kad priklausomybė gali būti tarpininkaujama šiame regione, dar labiau patvirtina teoriją, kad šios ganglijos reguliuoja motyvaciją ir elgesio mokymąsi.
Tai gali padėti paaiškinti šio regiono svarbą stuburinių smegenyse. Kiekviena stuburinių gyvūnų rūšis turi bent pradinius kairiųjų bazinių ganglijų elementus. Tai rodo, kad jis greičiausiai vaidins svarbų vaidmenį judėjime, elgesyje ir primityviuose motyvacijos impulsuose.
Kai kurie ekspertai mano, kad kairiajame baziniame ganglijoje daugumoje savo neuronų vietoj stimuliuojančio neuromediatoriaus glutamato naudoja slopinamąjį neuromediatorių gama-aminosviesto rūgštį (GABA), todėl sunku suprasti jo funkciją. Šie neuronai veikia slopindami savo taikinių veiksmus, todėl yra daugybė galimybių pakeisti jų įtakos požymius. Tai sukuria galimybę dar daugiau teorijų apie tai, kurios nervų grupės dirba kartu, kad pasiektų savo poveikį.
Nepaisant GABA svarbos visoms ganglijoms, viename iš jos skyrių yra didelė cholinerginių neuronų koncentracija. Striatumo ląstelės, nors ir sudaro tik nedidelę visų ganglijų dalį, beveik išimtinai naudoja sužadinantį neuromediatorių acetilcholiną. Nemažai neuronų regione taip pat naudoja dopaminą. Manoma, kad tai yra neuromediatorius, kuris mažina motyvaciją ir priklausomybę, taip pat vaidina svarbų vaidmenį progresuojant Parkinsono ligai, todėl jo svarbos bendrai kairiųjų bazinių ganglijų funkcijai negalima pervertinti.