Šalutinis linų sėmenų aliejaus poveikis yra minimalus, kai priedas vartojamas mažomis dozėmis, nors gali būti žalingas šalutinis poveikis, kai jis vartojamas didesnėmis dozėmis. Tipiškas linų sėmenų šalutinis poveikis yra viduriavimas ir alerginės reakcijos. Kai kurie tyrimai rodo, kad linų sėmenų aliejus gali padidinti vyrų prostatos vėžio riziką.
Linų sėmenys, kilę iš augalo Linum usitatissimum, kilę iš Viduržemio jūros regiono ir Indijos. Aliejus, išgaunamas iš linų sėmenų, dažniausiai naudojamas kaip sveikatos priedas, nors jis taip pat yra įtrauktas į daugelį maisto produktų. Linų sėmenų aliejaus propaguotojai dažnai teigia, kad jis turi įvairios naudos sveikatai, įskaitant padeda virškinti, mažina uždegimą, kontroliuoja cholesterolio kiekį ir apsaugo nuo reumatoidinio artrito.
Tačiau daugelis mokslinių tyrimų rodo, kad naudos iš linų sėmenų aliejaus yra mažai, ar išvis. Kitos tariamos linų sėmenų aliejaus naudos sveikatai yra dėmesio deficito hiperaktyvumo sutrikimo (ADHD) simptomų sumažėjimas, širdies ligų rizikos sumažėjimas, krūties vėžio rizikos sumažėjimas ir riebalų rūgščių kiekio kraujyje sumažėjimas. Yra įtikinamų įrodymų, kad linų sėmenų aliejus nesumažina kraujo riebalų rūgščių, tačiau žiuri vis dar vertina kitus naudą, nes tyrimai nėra įtikinami.
Vienas iš labiausiai paplitusių linų sėmenų aliejaus šalutinių poveikių yra viduriavimas, ypač kai aliejus vartojamas dideliais kiekiais. Dauguma linų sėmenų aliejaus šalutinių poveikių atsiranda, kai linų sėmenų aliejų vartoja žmonės, turintys tam tikrų sąlygų. Pavyzdžiui, linų sėmenų aliejaus šalutinis poveikis nėščioms moterims gali būti pavojingas. Linų sėmenų aliejaus vartojimas antrąjį ir trečiąjį trimestrą gali padidinti priešlaikinio gimdymo riziką. Dėl šios priežasties nėščiosioms patariama vengti linų sėmenų aliejaus.
Linų sėmenų aliejus taip pat gali padidinti kraujavimo riziką, ypač pacientams, turintiems kraujavimo sutrikimų arba pacientams, kuriems neseniai buvo atlikta operacija. Kai kurie ekspertai rekomenduoja nevartoti linų sėmenų aliejaus dvi savaites prieš ar po operacijos. Geriausia vengti šio papildo maitinant krūtimi, nes aliejaus šalutinis poveikis žindančioms motinoms nežinomas.