Fondo buhalterio pareigos tradiciškai randamos ne pelno siekiančioje organizacijoje arba valdžios sektoriuje, kurios tikslas yra užtikrinti fiskalinę atskaitomybę. Atlikdamas šį vaidmenį, asmuo pajamas skirsto į kategorijas arba lėšas, kad nustatytų šaltinį ir lėšų panaudojimo būdą. Vadinasi, fondo buhalteris yra atsakingas už geros priežiūros praktikos demonstravimą, organizacijos finansinės padėties nustatymą, planavimą ir biudžeto sudarymą, pinigų srautų stebėjimą ir bendravimą su pagrindinėmis suinteresuotomis šalimis.
Fondų apskaitoje siekiama kategoriškai paskirstyti finansines operacijas tarp bendrųjų ir riboto naudojimo fondų, nes kiekvienas fondas turi konkrečią ir įgaliotą paskirtį. Bendrasis fondas padengia veiklos išlaidas, pvz., darbuotojų atlyginimus, raštinės reikmenis ir priežiūros išlaidas; priešingai, specialios lėšos yra ribojamos siekiant užtikrinti, kad jos būtų naudojamos tik finansuoti veiklai, kurią lėšų teikėjas arba donoras konkrečiai nurodė kaip patvirtintas išlaidas. Iš esmės fondų apskaita leidžia organizacijoms stebėti išlaidų veiklą, siekiant užtikrinti, kad ribotos lėšos būtų tinkamai paskirstytos. Nors organizacijai svarbu tinkamai paskirstyti savo pinigus verslo požiūriu, tai taip pat svarbu tiems žmonėms, kurie organizacijai teikia lėšas. Žmonės, dovanojantys pinigus labdarai, verslui ar kitai organizacijai, nori žinoti, kad organizacija tuos pinigus naudoja efektyviai.
Fondo buhalteris yra atsakingas už atskaitomybės ir priežiūros demonstravimą, įvertindamas, ar organizacija tinkamai panaudojo lėšas ir tinkamai tai dokumentavo. Fondo buhalteris taip pat nustato įmonės finansinę padėtį, nustatydamas turimus išteklius, jų vertę ir bet kokį finansinį poveikį, kurį organizacija gali patirti, jei jie būtų pakeisti arba pašalinti. Fondų buhalteriai grupuoja turtą ir įsipareigojimus pagal konkrečią paskirtį, kuriai jie turi būti naudojami, kad ribotos ir neapribotos lėšos liktų atskirai.
Tradicinės į pelną orientuotos įmonės daugiausia dėmesio skiria pelningumui ir turi vieną didžiąją knygą. Ir atvirkščiai, fondų buhalteriai turi daugiau nei vieną knygą, priklausomai nuo donoro ir išlaidų veiklos. Pavyzdžiui, gali būti bendroji sąskaita, naudojama neapribotoms lėšoms, ir pastatų fondo sąskaita, naudojama statyboms skirtiems pinigams sekti.
Biudžeto sudarymas taip pat yra pagrindinė atsakomybė, nes fondų buhalteriai turi nustatyti, kaip paskirstomos lėšos ir kokių išteklių reikia konkrečiam projektui. Be to, fondo buhalteris yra atsakingas už organizacijos fiskalinių rezultatų įvertinimą, palyginti su siūlomais tikslais, siekiant užtikrinti veiklos efektyvumą. Šioje pozicijoje vertinama fondo veikla, kad būtų galima stebėti išlaidų veiklą ir planuoti nenumatytus atvejus. Galiausiai, veiksmingas fondo buhalteris glaustai, aiškiai ir patikimai perduoda svarbią finansinę informaciją sprendimus priimantiems asmenims.