Vykdomasis operacijų direktorius vadovauja ne pelno organizacijos skyriams, kurie sprendžia kasdienes funkcijas, tokias kaip finansai, technologijos, žmogiškieji ištekliai ir programos. Jis yra tiesiogiai atskaitingas organizacijos vykdomajam direktoriui (ED) ir taip pat gali veikti vietoj jo, kai ED nepasiekiamas. Pareigos yra analogiškos pelno siekiančios korporacijos vadovo arba operacijų viceprezidento pareigoms.
Ne pelno organizacija turi valdymo struktūrą ir pareigų sistemą, kuri atspindi jos programų ir paslaugų kūrimą, o ne produktus. Tačiau ne pelno organizacijos yra korporacijos, todėl pareigybių pavadinimai, ypač vadovų lygmeniu, paprastai turi pelno siekiančių atitikmenų, kurie atlieka tas pačias pagrindines funkcijas skirtinguose kontekstuose. Įprastos ne pelno organizacijos vyriausiosios vykdomosios pareigos paprastai vadinamos vykdomuoju direktoriumi.
Ne pelno organizacijoms paprastai neleidžiama užimti per daug administracinių pareigų, todėl vykdomieji sluoksniai paprastai yra ploni, o vienas vadovas nešioja daug skrybėlių. Didėjant ne pelno organizacijos dydžiui ir didėjant jos biudžetui bei darbuotojų skaičiui, ji kartais gali sau leisti struktūrizuoti vykdomuosius lygius taip, kad jie būtų panašesni į pelno siekiančią korporaciją. Viena iš pozicijų, kurios dažnai pridedamos šiuo metu, yra operacijų vykdomasis direktorius. Šios pareigos skirtos tam, kad kai kurios kasdienės valdymo užduotys būtų pašalintos iš ED, kad jis galėtų sutelkti dėmesį į viešuosius ryšius, lėšų rinkimą, strateginį planavimą ir darbą su direktorių valdyba.
Turbūt lengviausia galvoti apie vykdomąjį direktorių, kuris vadovauja personalui ir visada yra biure. Įprastoje ne pelno organizacinėje struktūroje operacijų vykdomasis direktorius yra tarp ED ir visų kitų darbuotojų pareigų, išskyrus plėtros direktorių. Jam tiesiogiai pavaldus finansų, žmogiškųjų išteklių, teisės, techninės priežiūros, technologijų ir programų vadovai. Jo darbas – užtikrinti, kad viskas vyktų sklandžiai ir pagal bendrą organizacijos strateginį planą.
Operacijų vykdomasis direktorius taip pat veikia vykdomojo direktoriaus vardu, jei ED nepasiekiamas. Daugumoje organizacinių struktūrų jis yra antrasis vadas ir turi teisę daryti viską, ką ED yra įgaliotas daryti jam nesant. Vykdomasis veiklos direktorius turi būti pasirengęs bendrauti su visuomene ir žiniasklaida, dirbti su direktorių taryba ir prireikus valdyti lėšų rinkimą, net jei šios užduotys nėra pagrindinė jo atsakomybė. Pozicija taip pat paprastai yra atsakinga už strateginę organizacijos veiklos plėtrą, pavyzdžiui, sprendžiama, kada įsigyti papildomų biuro patalpų, ar kada plėstis į naują programos sritį.