Buveinių tvarkymo tikslas – sukurti geriausią įmanomą žmogaus gyvenamosios vietos ir gamtos derinį. Laukinės gamtos išsaugojimo operacijos padeda išlaikyti pusiausvyrą, apsaugodamos nykstančius augalus ir gyvūnus nuo žmogaus įsikišimo. Ir atvirkščiai, daugelis miškų valdymo programų naudoja žmogaus įsikišimą kaip būdą paspartinti augimo procesus, kurie natūraliai vyktų dešimtmečius ar net šimtmečius. Retkarčiais gyvūnų ar augalų veikla kelia grėsmę žmonijai, o tokiais atvejais pusiausvyrą atkuria laukinės gamtos tvarkymo organizacijos.
Dažnai nykstančių rūšių teritorijoms apsaugoti naudojami buveinių tvarkymo metodai. Pavyzdžiui, dėl polinkio į laukinius gaisrus Pietų Afrikos Fynbos krūmynuose gyvena įvairios rūšys, kurios prisitaikė prie šių atšiaurių sąlygų. Daugelio šių rūšių nėra niekur kitur žemėje. Siekiant užtikrinti šių augalų ir gyvūnų išlikimą, labai stengiamasi išvengti žmonių sąveikos su šia vietove.
Vykdant labiau nukreiptas laukinės gamtos išsaugojimo iniciatyvas, norint išgelbėti gyvūną, gali prireikti žmogaus veiksmų. Tokiais atvejais nykstančių rūšių atstovai gali būti sugauti ir patalpinti į dirbtinę aplinką apsaugos ir dauginimosi tikslais. Numatytas tokio tipo programos rezultatas paprastai yra gyvybingų veisimosi telkinių atkūrimas. Daugeliu atvejų galutinis tikslas yra grąžinti rūšį į natūralią buveinę.
Didelio medžių augimo ploto buveinių tvarkymas dažnai vadinamas miško tvarkymu. Nors pagrindinis šio tipo apsaugos taškas yra medžiai, pastangos reguliariai plečiamos įtraukiant augalų ir gyvūnų buveines, kurias suteikia šios teritorijos. Šiaurės Amerikoje miškų tvarkymas pirmiausia tiria kietmedžio medynus, tačiau principai gali būti išplėsti, kad apimtų ir atogrąžų miškus bei džiungles.
Standartinis ekologinis miško buveinių tvarkymo tikslas yra augimo modelis, vadinamas aukštu mišku. Šioje ekosistemoje vaizduojami visi medžių augimo etapai – nuo atžalų iki nukritimo. Be to, gyvūnų ir augalų gyvenimas yra gausus ir įvairus. Jei nebūtų trikdomas, natūraliai atsirastų aukšti miško biomai. Taikant kruopščią miškotvarkos praktiką, pvz., selektyvų medienos ruošą, šio tipo biomas gali būti išsaugotas ir sustiprintas.
Retais atvejais buveinių tvarkymo tikslas yra neleisti gyvūnams kelti pavojaus žmonių populiacijoms ir turtui. Pavyzdžiui, kai kuriose vietovėse dėl nekontroliuojamo veisimosi, ribotos medžioklės ir prieigos prie žmogaus maisto šaltinių baltauodegių elnių populiacija išaugo. Dėl to labai padaugėjo pranešimų apie žalą turtui ir sužalojimus dėl elnių ir transporto priemonių avarijų. Taip pat padaugėjo didelės žalos pasėliams dėl šertų elnių. Vietinių laukinės gamtos valdymo biurų atsakymai apima gyvūnų perkėlimo programas ir ilgesnius medžioklės sezonus.