Eglės gali tapti daugybės grybelinių infekcijų ir parazitinių augalų ar vabzdžių kenkėjų invazijos aukomis, o eglių ligos gali paveikti medžio spyglius, šakas ar kamieną, o kitos pradeda naikinti įsiverždamos į šaknis. Medžiai su spygliuotomis ligomis dažnai pasireiškia simptomais per kelis mėnesius po užsikrėtimo, tačiau šaknų ligos gali išgyventi medyje dešimtmečius, lėtai susilpnindamos visą medį. Vietiniai cheminiai purškalai išnaikina kai kurias eglių ligas, tačiau dėl kitų reikia pašalinti medžius. Arboristai paprastai gali nustatyti įvairių rūšių eglių ligas ir rekomenduoti veiksmų kryptį.
Grybelinės infekcijos yra dažniausiai pasitaikančios įvairių rūšių eglių infekcijos. Adatos iš geltonos tampa rudos, o atidžiai apžiūrėjus padidinamuoju stiklu, matosi mažytės juodos dėmės. Pavyzdžiui, Rizosphaera kalkhoffii sukelia būklę, vadinamą adatos įmetimu, nes paveiktos spygliai miršta ir nukrenta nuo medžio. Per trejus ar ketverius metus paveiktos šakos visiškai nevaisingos. Kriptosporos vėžys įsiveržia į šakas ir juda link kamieno, todėl pasikeičia balta spalva ir susidaro derva, kuri nuteka per medį.
Grybelinės infekcijos, kurias sukelia Inonotus tomentosus arba Armillaria, paprastai įsiveržia į egles prie šaknų. Užkrėsta mediena atrodo pakitusi spalva ir susidaro puvinio kišenės. Šios eglės ligos dažniausiai gamina grybus medžio apačioje. Oportunistiniai įsibrovėliai naikina medį lėtai, išgyvendami 20 ar 30 metų, išeikvodami daug maistinių medžiagų ir vandens. Eglių šaknų ligos taip pat mažina medžio tvirtumą ir stabilumą, todėl net didžiausi visžaliai augalai gali nuvirsti pučiant stipriam vėjui ar sezoninėms audroms.
Išlaikant medžių sveikatą tinkamai prižiūrint egles, galima išvengti didelės žalos. Arboristai siūlo laistyti tik žemės lygyje, nes tanki eglių lapija turi tendenciją sulaikyti drėgmę. Kai spyglių ir šakų vanduo neišvengiamas, laistykite anksti ryte, kad išdžiūtų iki išnaktų. Specialistai taip pat pataria aplink medžio apačią užberti 3–4 colių (7.5–10 cm) mulčio, kad sulaikytų drėgmę ir apsaugotų nuo galimų sužalojimų dėl vejapjovės. Paukščiai, vabzdžiai, lietus ir vėjas dažnai perneša sporas iš vienos vietos į kitą, todėl poveikio prevencija yra mažai tikėtina.
Lipnios parazitinio augalo – rytinės eglės nykštukinio amalo – sėklos taip pat įvairiais būdais keliauja iš šeimininko į šeimininką. Patekusi į medžio šaką, sėkla išdygsta, šaknų sistema įsirausia į žievę ir pažeistose vietose netenka maisto bei vandens. Iš šakos ilgainiui išauga matomi daigai, vadinami raganų šluotais, kurių vidutinis aukštis yra mažesnis nei vienas colis, o spalva – nuo oranžinės iki rudos. Žydintys daigai gali paskleisti sėklas keliasdešimt pėdų (1 pėda = 30 cm) atstumu nuo kilmės medžio. Nors namų savininkai gali genėti daigus, užkratas lieka giliai šakose, todėl galiausiai reikia visiškai pašalinti medžius.
Eglės ligos taip pat gali atsirasti dėl vabzdžių lervų buvimo. Įvairių rūšių kandys, voratinklinės erkės ir vapsvos deda kiaušinėlius ant augančių eglių. Didesni vabzdžių užkrėtimai gali pasirodyti kaip kokonai arba lizdai, pritvirtinti prie spyglių ir šakų. Išsiritusios lervos minta medžio pumpurais ar spygliais. Įvairūs skysti pesticidai paprastai pašalina užkrėtimą, apsaugodami medį nuo tolesnės žalos.