Tradiciniame bazilikų pesto sudėtyje yra daug riebalų iš alyvuogių aliejaus, sūrio ir riešutų. Nors riebalai iš aliejaus ir riešutų yra nesotieji ir paprastai laikomi sveikais širdžiai, virėjas gali norėti paruošti sveiką pesto, kuriame būtų mažiau riebalų ir mažiau kalorijų, atsisakydamas kai kurių arba visų riebių ingredientų. Virėjas taip pat gali atsisakyti sūrio arba pakeisti jį neriebesniu, kad gautų sveikesnį pesto. Jei baziliko nėra, ji gali jį pakeisti kitais žalumynais, pavyzdžiui, argula ar lapiniais kopūstais.
Paprastai riešutai, tokie kaip pušies riešutai arba graikiniai riešutai, dedami į pesto skonį ir tekstūrą. Riešutai į patiekalą prideda ir riebalų, ir šiek tiek baltymų. Norėdami pagaminti sveiką pesto, virėjas gali norėti sumažinti į receptą įtrauktų riešutų kiekį. Pavyzdžiui, jei recepte reikalaujama 1/4 puodelio (25 gramų) pušies riešutų, ji gali sumažinti kiekį iki 2 šaukštų (12 gramų). Graikiniuose riešutuose yra daug omega-3 riebalų rūgščių, todėl virėjas gali norėti juos naudoti vietoj pušies riešutų.
Norėdami dar labiau sumažinti sveiko pesto kalorijų kiekį, virėjas gali sumažinti naudojamo parmezano ar kito kieto, stipraus sūrio kiekį. Virėjas gali paversti pesto veganu, pakeisdamas parmezaną minkštu arba šilkiniu tofu. Ji taip pat gali naudoti nugriebtą rikotos sūrį kartu su nedideliu kiekiu parmezano. Ricotta arba tofu padažui suteiks ir baltymų. Jei norite skanesnės versijos, ji gali pabandyti pakeisti parmezaną ir alyvuogių aliejų ožkos sūriu.
Daugelyje pesto receptų aliejaus taip pat galima sumažinti iki pusės, kad sumažėtų kalorijų ir riebalų kiekis. Norėdami kompensuoti sumažėjusį aliejaus kiekį, virėjas turės įpilti kito skysčio. Vandenį galima naudoti pesto skiedimui. Citrinų sultys suteiks padažui šiek tiek aštrumo. Jei sumažinsite alyvuogių aliejaus kiekį, virėja turėtų naudoti geriausią aliejų, kurį tik gali rasti, kad įsitikintų, jog jo skonis išryškės.
Sveikas pesto neapsiriboja vien baziliko lapeliais. Kai kurie virėjai bazilikus pakeičia petražolėmis, ypač žiemos mėnesiais, kai šviežio baziliko gali nebūti. Kitas variantas – naudoti rukolą, kuri suteikia pesto pipirinio skonio. Norėdami gauti daugiau maistinių medžiagų, virėjas į pesto kartu su bazilikais gali įberti saują kopūstų.