Kaip ir daugelis duonos gaminių, marmurinė ruginė duona gali būti gaminama įvairiais būdais, kurie patinka skirtingiems žmonėms. Tokie veiksniai, kaip ar buvo naudojamas starteris, šviesios ir tamsios tešlos balansas ir tai, ar kepalėje yra kmynų, gali nulemti, kas konkrečiam žmogui yra geriausia marmurinė ruginė duona. Taip pat yra keletas kitų aplinkybių, pavyzdžiui, kur duona buvo kepta ir kepalo svoris, kurie gali padėti pasirinkti geriausią marmurinę ruginę duoną.
Vienas iš pirmųjų dalykų, į kurį žmogus turėtų atkreipti dėmesį rinkdamasis marmurinę ruginę duoną – tai, kur buvo pagamintas duonos kepalas. Kepyklos, kurios maišo ir kepa duoną toje vietoje, kur ji parduodama, dažniausiai turės minkštesnį ir ilgiau išliks. Profesionalioje kepyklėlėje pagaminta marmurinė ruginė duona, siunčiama į parduotuvę parduoti, gali turėti savitesnį skonį, nors lentynoje gali išsilaikyti neilgai.
Kepant marmurinę ruginę duoną dažnai nepastebima, ar naudojamas starteris. Užkandis – sendintas tešlos gabalas, naudojamas duonai rauginti. Naudojant užkandį, duonos gaminiai yra minkštesnės plutos ir kramtesnės tekstūros. Ruginės duonos, kurioms naudojamos tiesioginės mielės, plutelė bus kiek kietesnė, o vidinė tekstūra – lengvesnė. Pradedančiųjų požiūriu geresnė duonos rūšis yra asmeninio skonio reikalas.
Ne tik vizualinis aspektas, bet ir kepalo marmuro pusiausvyra gali būti svarbi. Ar daugiau šviesių, ar tamsių rugių, gali turėti įtakos galutinio duonos saldumui ir skonio stiprumui. Šis skirtumas gali turėti įtakos tam, ką kas nors laiko geriausia rugine duona.
Sprendžiant, kuri yra geriausia, reikia atsižvelgti į galutinį marmurinės ruginės duonos panaudojimą. Jei kepalas naudojamas sumuštiniams, pavyzdžiui, sūdyta jautiena ar pastrami, kepalas turi turėti subalansuotą šviesių ir tamsių rugių kiekį ir stiprų rugių kvapą. Šiuo atveju kmynai gali būti naudingi, tačiau jie taip pat yra skonio reikalas.
Jei marmurinę ruginę duoną ketinate naudoti sūriams ar saldžioms užtepėlėms, prie priedo gali tikti kepalas be sėklų su lengvais trupiniais. Tai vis tiek turi priimti žmogus, perkantis ruginę duoną. Bet kuriuo atveju geras marmurinės ruginės duonos kepalas turėtų jaustis sunkus dėl savo dydžio, o paspaudus pluta turėtų būti šiek tiek glotni, kad būtų užtikrintas jo šviežumas.