Patinusios rankos ir sąnarių skausmas yra dažniausiai pranešami mišrios jungiamojo audinio ligos simptomai ir kartais gali būti supainioti su kitomis panašiomis ligomis. Papildomi simptomai gali būti raumenų silpnumas, nuovargis ir rijimo pasunkėjimas. Gali atsirasti odos pakitimų, pvz., raudonų dėmių arba atsirasti navikų, kartais kartu su plaukų slinkimu. Raynaud reiškinys, būklė, galinti sukelti rankų ir kojų pirštų skausmą ir spalvos pasikeitimą, yra vienas iš dažniausių šios ligos simptomų. Bet kokie individualūs klausimai ar rūpesčiai dėl mišrios jungiamojo audinio ligos turi būti aptarti su gydytoju ar kitu medicinos specialistu.
Rankų tinimas yra dažniausias šios rūšies reumatinės ligos simptomas, dėl kurio pirštai dažnai ištinsta iki dešrelių. Dauguma pacientų taip pat praneša apie sąnarių skausmą. Dauguma pacientų, sergančių mišria jungiamojo audinio liga, taip pat turi tam tikrą artritą, dėl kurio sąnariai palaipsniui deformuojasi ir sukelia dar didesnį skausmą.
Sunku ryti arba išlaikyti maistą skrandyje yra galimi mišrios jungiamojo audinio ligos simptomai. Odos pokyčiai taip pat dažnai atsiranda ir gali būti įvairių formų. Ant akių vokų ar pirštų gali atsirasti raudonų dėmių. Mažos kraujagyslės, vadinamos kapiliarais ant veido ar rankų, gali išsiplėsti ir sukelti navikų susidarymą. Plaukai taip pat gali slinkti bet kurioje kūno vietoje.
Raynaud reiškinys yra sveikatos būklė, dėl kurios kai kurios kūno dalys, ypač rankos ir pėdos, nutirpsta, dilgčioja arba skauda, kai yra veikiamos šaltos temperatūros. Taip pat yra tam tikra odos spalvos pakitimo seka, kuri linkusi atsirasti, kai oda net trumpą laiką yra veikiama šaltos temperatūros. Kai kuriais atvejais taip pat gali būti pažeista nosis, lūpos ar kitos kūno vietos.
Papildomi mišrios jungiamojo audinio ligos simptomai gali būti veido ar galvos tirpimas arba fizinio jutimo praradimas. Kai kuriems su šia būkle gali išsivystyti inkstų liga. Plaučių sutrikimai pasireiškia daugeliui šia liga sergančių žmonių ir gali labai apriboti gebėjimą kvėpuoti. Dauguma simptomų yra panašūs arba identiški įvairioms kitoms sveikatos sąlygoms, įskaitant vilkligę ar reumatoidinį artritą. Nors tai kartais gali atidėti tikslią diagnozę, bet kokie simptomai, kurie gali būti susiję su mišria jungiamojo audinio liga, turi būti aptarti su medicinos specialistu, kad būtų galima atlikti tolesnį medicininį įvertinimą.