Nors pats turinys nėra ypač kenksmingas, vandens buteliuose gamybos procesas aplinkai nedaro jokios naudos. Daugelis savo sveikatą besirūpinančių vartotojų tvirtai tiki, kad jis yra geresnis už įprastą vandentiekio vandenį, o vandens pramonės pelnas kasmet siekia milijardus JAV dolerių (USD). Net jei pramonės išpilstymo ir gabenimo aspektai daro neigiamą poveikį aplinkai, galutinis rezultatas vis tiek laikomas sveikesne alternatyva nei vanduo iš čiaupo, apdorojamas komunaliniuose valymo įrenginiuose.
Viena iš pagrindinių vandens buteliuose gamybos problemų yra priklausomybė nuo iškastinio kuro. Neapdorotas plastikas turi būti šildomas prieš įpurškiant jį į butelio formos pūtimo formas, o šis šilumos šaltinis dažnai yra elektra arba gamtinės dujos, kurios abu gaminami naudojant iškastinį kurą. Tada paruošti buteliai turi būti išvežti sunkvežimiais arba traukiniais, kurie taip pat degina natūralų iškastinį kurą. Be to, naudokite papildomas pakavimo medžiagas, tokias kaip plastikinė plėvelė ir kartonas. Vien butelių gamyba daro neigiamą poveikį aplinkai.
Taip pat kyla klausimas dėl plastikinių butelių perdirbimo programų perspektyvumo. Nors plastikas, naudojamas daugumoje išpilstymo įrenginių, laikomas perdirbamu, dauguma panaudotų tarų niekada nemato perdirbimo centro vidaus. Jie arba siunčiami į sąvartynus, arba paliekami kaip šiukšlės. Šie plastikiniai buteliai negenda labai greitai, o daugelis jų suyra išskiria kenksmingų dujų. Kol perdirbimas bus savanoriškas, panaudoti vandens buteliai ir toliau gamins šias dujas ir užims vertingą vietą sąvartynuose.
Kai kurie ekspertai abejoja, ar pirmiausia reikia vandens buteliuose. Keletas tyrimų parodė, kad daugelis šių vandenų nėra gaminami iš natūralių ar saugomų šaltinių, kuriuos reklamuoja jų gamintojai. Kai kurie iš jų yra šiek tiek daugiau nei išgrynintas vandentiekio vanduo, gaunamas iš to paties šaltinio kaip ir komunalinis geriamasis vanduo. Vadinamasis „šaltinio vanduo“ arba „artezinio šulinio vanduo“ taip pat gali turėti natūralių teršalų, nes vanduo prasiskverbia per žemę prieš išpilstant į butelius. Šalia išpilstyto ir apdoroto komunalinio vandentiekio vandens skonio bandymai dažnai atskleidė labai mažai pastebimų skonio ar kokybės skirtumų.
Kadangi vanduo buteliuose laikomas „maistu“, reguliavimas ir bandymai JAV priklauso Maisto ir vaistų administracijai (FDA). Šiuo metu FDA reikalauja, kad gamintojai kartą per savaitę patikrintų savo gaminius, ar nėra kenksmingų teršalų. Miesto vandentiekio vanduo priklauso JAV aplinkos apsaugos agentūros (EPA) jurisdikcijai. EPA bandymų reikalavimai vandentiekio vandeniui yra daug griežtesni, todėl vandens valymo įrenginiai turi atlikti teršalų tyrimus kelis kartus per dieną. Kalbant apie galimą žalą žmonėms ir gyvūnams, nepatikrintas vanduo buteliuose gali būti daug pavojingesnis nei komunalinis vanduo iš čiaupo.
Kai kurie vandens valymo specialistai rekomenduoja nepildyti plastikinių vandens butelių gėlu vandeniu iš čiaupo, nes plastikas gali išplauti į vandenį nuodingas chemines medžiagas, kai jos skaidosi, o tai tampa problemiškesnė, kai buteliai sensta. Šviežias geriamasis vanduo turi būti laikomas stikliniuose ar pastovesniuose plastikiniuose induose, o ne vienkartiniuose plastikiniuose buteliuose.
Nors vanduo buteliuose tikrai yra patrauklus kaip nešiojamas rehidratacijos šaltinis, jis daro tam tikrą neigiamą poveikį aplinkai. Kai kurie ekspertai siūlo naudoti namų filtravimo sistemą, kad pagerintumėte standartinio vandens iš čiaupo skonį ir kokybę, o ne pirkdami papildomą vandenį gerti. Filtrai gali pašalinti beveik visus pavojingiausius vandenyje esančius teršalus ir pašalines medžiagas, o išvalytą vandenį iš čiaupo galima laikyti patvaresnėse talpyklose, kurios daro daug mažesnį poveikį aplinkai nei vienkartiniai plastikiniai buteliai.