Nenormalių ar pažeistų audinių sritys, vadinamos pažeidimais, yra dažnas įgyto imunodeficito sindromo (AIDS) simptomas. Yra keletas skirtingų AIDS pažeidimų tipų, kuriuos sukelia oportunistinės infekcijos ir vėžys, kurie puola sergantįjį, nes AIDS susilpnina jo imuninę sistemą. Labiausiai matomi AIDS pažeidimų tipai yra ant odos, tačiau jie gali atsirasti ir vidaus organuose, tokiuose kaip smegenys ir inkstai.
Daugumai plačiosios visuomenės geriausiai žinoma AIDS pažeidimų priežastis yra Kapoši sarkoma – kraujo ir limfinių kraujagyslių vėžio forma, kurią sukelia su Kapoši sarkoma susijęs herpesvirusas. Daugumos viruso nešiotojų jis nėra paveiktas, tačiau žmogui, kurio imuninė sistema nusilpusi, aukos organizme gali išsivystyti greitai plintantys piktybiniai navikai. Paprastai tai pirmiausia matoma kaip iškilę, patamsėję odos pažeidimai, atsirandantys dėl kraujagyslių formavimosi iškraipymo, tačiau progresuojant kartais išplinta į burną ir kūno viduje. Kitos virusinės infekcijos, kurios dažniausiai pastebimos AIDS sergantiems pacientams, sukeliančios odos pažeidimus, yra olluscum contagiosum ir burnos bei lytinių organų herpes simplex virusas.
Kiti AIDS pažeidimai atsiranda nervų sistemoje. Toksoplazmozė – itin dažna pirmuonių infekcija, kuri daugeliui žmonių yra nekenksminga, tačiau itin pavojinga žmonėms, kurių imuninė sistema labai pažeista, gali sukelti smegenų ir akių pažeidimus AIDS sergantiems žmonėms. Kita infekcija, kuri yra paplitusi ir dažniausiai nekenksminga bendrajai populiacijai, pavojinga AIDS sergantiems pacientams, yra progresuojanti daugiažidininė leukoencefalopatija (PML). PML sukelia baltosios smegenų medžiagos pažeidimus, dėl kurių susilpnėja motorinė kontrolė; regėjimo, kalbos ir asmenybės pokyčiai; ir galiausiai mirtis be gydymo. Kita dažna AIDS sergančių žmonių smegenų pažeidimų priežastis yra naviko tipas, vadinamas pirmine centrinės nervų sistemos limfoma, kuri gali sukelti galvos skausmą, traukulius ir demenciją.
Kitose kūno vietose taip pat gali atsirasti pažeidimų dėl AIDS, ją lydinčių oportunistinių ligų ar šalutinio vaistų nuo AIDS poveikio. Išplėstinė Kapoši sarkoma gali sukelti AIDS pažeidimus virškinimo trakte, plaučiuose ar limfmazgiuose. Didelė dalis AIDS sergančiųjų taip pat yra užsikrėtę hepatitu C, kuris sukelia kepenų pažeidimus ir gali sukelti nedidelius odos pažeidimus, dažniausiai ant kojų. Antiretrovirusiniai vaistai, dažniausiai naudojami AIDS vystymuisi sulėtinti, taip pat gali pakenkti kepenims, kai vartojami dideliais kiekiais arba ilgą laiką. Kai kuriems AIDS sergantiems žmonėms išsivysto su ŽIV susijusi nefropatija – būklė, kuri sukelia inkstų pažeidimus ir galiausiai gali sukelti inkstų nepakankamumą.