Pūlinys atsiranda dėl pūlių susikaupimo kūno audinyje, kuriame dėl infekcijos susidarė ertmė. Absceso patofiziologija yra imuninių atsakų serija, prasidedanti baltųjų kraujo kūnelių migracija į infekciją ir skysčiu užpildytos ertmės atsiskyrimu nuo aplinkinių sveikų audinių. Kai kurie abscesai atsiranda dėl užsikimšusių liaukų kanalų, o kitus sukelia užkrėsti sužalojimai, dažnai dėl Staphylococcus aureus bakterijos.
Pūlinių patofiziologija prasideda pažeistame audinyje, kai imuninė sistema neleidžia plisti svetimoms medžiagoms ir potencialiai kenksmingiems mikroorganizmams. Infekcijos metu daug baltųjų kraujo kūnelių, ypač neutrofilų, migruoja į pažeistus audinius. Jie tai daro gavę signalus iš citokinų, kurie įspėja apie ląstelių mirtį ir sužalojimą. Pūliai, negyvų ląstelių ir cheminių imuninio atsako mediatorių mišinys, užpildo vietą aplink vietą, kuri yra atskirta nuo sveikų audinių susidarius pūlinio sienelei. Absceso patofiziologija gali sukelti gyvybei pavojingų pasekmių, jei tokiuose organuose kaip kepenys susidaro ertmės.
Esant epiduriniam abscesui, pūliai kaupiasi virš išorinės kietosios žarnos membranos, dengiančios smegenis ir stuburą, patindamos prie kaukolės ar stuburo. Šios retos infekcijos yra labiau tikėtinos nugaros smegenyse nei kaukolėje. Kaukolės ar stuburo absceso patofiziologija dažnai komplikuojasi dėl nervinio audinio pažeidimo dėl skysčio slėgio didėjant patinimui. Danties abscesas atsiranda dėl vietinės infekcijos žandikaulyje, aplink nervą, sudarantį danties šaknį. Jis sukelia stiprų skausmą, o plyšus gali pasiųsti bakterijas į kraują, o tai gali sukelti sisteminę infekciją.
Liaukų užsikimšimas gali užsandarinti audinio plotą, dėl kurio užsikrėtus gali susidaryti abscesas. Įvairūs mikroorganizmai gali sukelti Bartholin absceso patofiziologiją, skausmingą Bartholin liaukos patinimą makštyje. Jei liaukose, atsakingose už sveiką makšties sekretą, užsikimšęs latakas, laikui bėgant gali kauptis skystis. Tada bakterijos gali užkrėsti patinusią liauką tiek, kad ji tampa labai jautri. Panašiai odos abscesai ar furunkuliai gali atsirasti dėl užsikimšusios prakaito liaukos.
Absceso patofiziologijos skirtumai neturi didelės įtakos pagrindiniam gydymui. Kadangi Staphylococcus aureus dažniausiai sukelia abscesus, tradicinis gydymas antibiotikais yra susijęs su chirurgija kaip dviem pagrindinėmis medicininės priežiūros priemonėmis. Tačiau šis organizmas išsivystė į meticilinui atsparų Staphylococcus aureas (MRSA), todėl padaugėjo antibiotikų, naudojamų komplikacijoms sumažinti. Daugeliui abscesų, ypač didesnių, reikės chirurginio gydymo, kad iš žaizdos būtų pašalintas pūlinys, kad jis tinkamai išgytų. Tai dažnai tiesa, nepaisant konkrečios infekcijos priežasties.