Virusai ir bakterijos yra veiksnių, dažniausiai sukeliančių gerklės skausmą ir pykinimą, sąraše. Aplinkos alergenai, ligos ir vaistai taip pat gali sukelti pykinimą ir sukelti gerklės skausmą kartu arba atskirai. Pacientai, gydomi vėžiu, dažnai skundžiasi, kad chemoterapija gali sukelti gerklės skausmą ir pykinimą, o spinduliuotė nuo vėžio paprastai sukelia pykinimą. Šie simptomai paprastai trunka nuo 24 valandų iki trijų dienų.
Užpuolus peršalimo virusui, gali skaudėti gerklę kaip neapdorotas, skausmingas pojūtis gerklės gleivinėje, labiausiai pastebimas ryjant. Sunkiais atvejais gali būti sunku nuryti ir dažnai atsiranda skreplių. Be peršalimo, krupas, gripas ir mononukleozė yra kiti specifiniai virusai, dažniausiai sukeliantys gerklės skausmą. Virusai, sukeliantys vaikiškas vėjaraupių ir tymų ligas, taip pat gali sukelti neapdorotą ir skaudančią gerklę.
Atrodo, kad 10–50 procentų bakterijų sukelto gerklės skausmo ir pykinimo atvejų kaltos streptokokų bakterijos, o po jų – arcanobacterium haemolyticum bakterijos, žinomos kaip bėrimo priežastys. Kitos specifinės bakterinės priežastys yra tonzilitas ir difterija. Šios oru plintančios bakterijos kartu su anksčiau nustatytais oru plintančiais virusais lengvai plinta nuo vieno sergančio žmogaus kitam, įsiskverbdamos į aplinkinį orą dėl sergančiojo čiaudulio ir kosulio priepuolių. Tada užkratai įkvepiami į kvėpavimo sistemą. Liečiant gleives ir mikrobus ant bendrų rankšluosčių, durų rankenų ir valgymo reikmenų, taip pat gali būti pernešami gerklės skausmą sukeliantys mikrobai.
Dėl pykinimo, kuris yra sutrikusio skrandžio, kuris bando išstumti savo turinį, būklė, pneumonija ir bronchitas yra pagrindinės bakterinės ir virusinės priežastys. Dažnai pykinimo kaltininkas yra gastritas, kurį sukelia E.coli bakterijos, salmonelės ir listerijos maiste ar vandenyje. Skrandžio gleivinės uždegimas, oficialiai vadinamas gastritu, taip pat gali atsirasti dėl skrandžio gripo.
Tokios ligos kaip pankreatitas, hepatitas ir vėžys dažnai sukelia pykinimą. Dažnai skrandį iškloję vėžiniai navikai aptinkami tik tada, kai pykinantis pacientas pradeda reguliariai vemti ir tada kreipiasi į gydytoją, kad paaiškintų ir diagnozuotų. Tokie kasdieniniai veiksniai kaip blogas kvapas, nemalonus maistas ir nerimas taip pat gali sukelti pykinimą; taip pat gali rytinis pykinimas ir nėštumas.
Kai gerklės skausmas ir pykinimas trunka ilgiau nei 72 valandas, aukos dažniausiai nusprendžia kreiptis į gydytoją. Dažnai skiriami receptiniai vaistai nuo pykinimo, tokie kaip prometazinas ar droperidolis. Esant gerklės skausmui, gydytojai dažnai atlieka streptokokų tyrimus ir skiria antibiotikų ar penicilino.