Sojos pavojus vyrams kyla dėl didelio moteriškojo hormono estrogeno kiekio, kurio yra sojoje ir sojos gaminiuose. Visų pirma, sojos turi įtakos vyriškos lyties spermos kokybei ir koncentracijai, ypač jei jos vartojamos dideliais kiekiais arba jei tiriamasis buvo veikiamas dideliu kiekiu įsčios. Neseniai Harvardo universitete atliktas tyrimas parodė, kad vyrų, turinčių mažą spermatozoidų skaičių, ir daug sojų maisto produktų vartojimo yra neabejotina koreliacija. Tyrimas atskleidė, kad vidutinė 80–120 milijonų suaugusio vyro spermatozoidų milimetre sumažėjo daugiau nei perpus, kai soja buvo raciono dalis. Šis atvejis yra labiau įtikinamas tiriant nutukusius vyrus, kurių spermos kiekis yra dar mažesnis dėl riebalinio audinio estrogenų gamybos savybių.
Mokslininkai mano, kad dėl prastos spermos koncentracijos kalti sojoje esantys izoflavonai (daidzeinas, genisteinas ir gliciteinas). Šie izoflavonai veikia kaip estrogenai, todėl slopina spermos gamybą. Be to, Londono Karaliaus koledžo profesorius Lynn Fraser taip pat perspėjo dėl izolflavono genisteino, kuris, kaip manoma, gali prisidėti prie spermos nesėkmės apvaisinti kiaušialąstę. Tačiau šios išvados buvo pagrįstos mėgintuvėliuose atliktais eksperimentais, o sojos pramonės institucijos prieštaravo, kad genisteinas, randamas sojos pagrindu pagamintuose produktuose, skirtingai reaguoja į gryną izoflavonų formą, kuri buvo naudojama atliekant tyrimą.
Sojų gausiausiai randama tokiuose maisto produktuose kaip sojos pupelės, tofu, tempeh, tofu arba sojų dešrelės, šoninė, mėsainiai, sojų pienas, sūris, jogurtas, ledai ir riešutai. Tačiau sojos ir sojos darinių yra maždaug 70 % visų maisto produktų, todėl jų suvartojimą sumažinti gali būti sunku. Pavyzdžiui, kiaulienos pyragai, pusryčių dribsniai, majonezas ir margarinas, dešros, lazanija, jautienos mėsainiai ir vištienos grynuoliai yra kai kurie maisto produktai, kuriuose soja yra pigių baltymų šaltinis. Sojų darinys lecitinas taip pat paplitęs kepyklų ir konditerijos pramonėje dėl savo veiksmingumo kaip emulsiklis.
Reikėtų pažymėti, kad sojos yra labai svarbi azijietiškos dietos dalis ir šiose šalyse nebuvo rasta jokių reikšmingų šalutinių poveikių. Tačiau verta nepamiršti, kad Azijos sojų dieta daugiausia pagrįsta fermentuotais sojos produktais, tokiais kaip miso sriuba ir tofu; manoma, kad fermentacijos procesas sunaikina chemines medžiagas, kurios aukščiau minėtuose eksperimentuose laikomos kenksmingomis.