Patogeninės bakterijos yra bakterijos, galinčios sukelti ligas. Paprastai žmones labiausiai domina bakterijų rūšys, kurios gali sukelti žmonių ligas, nors šios bakterijos taip pat gali užkrėsti kitus gyvūnus ir augalus. Kai kurios žinomos patogeninės bakterijos yra Streptococcus, Staphylococcus, Tuberculosis ir Escherichia coli, be daugelio kitų. Visame pasaulyje šios bakterijos sukelia daugybę ligų ir ligų epidemijų.
Intraląstelinės bakterijos yra patogeninės bakterijos, kurios, patekusios į žmogaus organizmą, visada sukelia ligas, priešingai nei sąlyginės bakterijos, kurios tam tikromis aplinkybėmis gali sukelti infekcijas ir ligas. Daugelis bakterijų yra sąlyginės, pasinaudodamos atsitiktinumu kaip atvira žaizda, kad pasikartotų ir išplatintų ligą. Oportunistinės bakterijos – tai bakterijos, kurios paprastai nesukelia ligų, bet sukels, jei paciento imuninė sistema susilpnėjusi.
Daugelis žmonių iš tikrųjų bet kuriuo metu turi daug bakterijų. Šios bakterijos žinomos kaip komensalinės arba „gerosios“ bakterijos, nes atlieka kai kurias gyvybiškai svarbias ir naudingas funkcijas žmogaus organizme. Pavyzdžiui, žarnyne esančios kommensalinės bakterijos padeda skaidyti ir virškinti maistą.
Patogeninės bakterijos gali plisti per žmonių populiaciją įvairiais būdais. Oras, vanduo ir dirvožemis yra įprasti pernešėjai, o žmonės taip pat gali perduoti bakterijas tiesiogiai vieni kitiems per fizinį kontaktą. Kai kurios bakterijos puikiai sugeba kolonizuoti tokias vietas kaip durų rankenos ir medicininė įranga, todėl jos gali lengvai pereiti nuo žmogaus prie kito, o kitos yra daug mažiau virulentiškos ir išnyks, jei per ilgai bus toli nuo žmogaus.
Tuberkuliozė yra viena iš pirmaujančių žudikų pasaulyje, todėl ji yra ypač įdomi patogeninė bakterija. Patogeninės bakterijos taip pat yra atsakingos už žarnyno problemas, tokias kaip lėtinis viduriavimas, ir gali sukelti infekcijas daugelyje kūno dalių. Kai kurios yra mirtinos, pavyzdžiui, Legionella bakterija, o kitos yra gana gerybinės, ypač jei galima gauti gydymą. Viena didžiausių problemų besivystančiame pasaulyje yra pagydomų bakterinių infekcijų, kurios nekontroliuojamos dėl galimybės gauti vaistų ir gydymo trūkumo, plitimas.
Patogeninių bakterijų sukeltos infekcijos gydymas apima antibiotikų, vaistų, specialiai sukurtų bakterijoms naikinti, vartojimą. Kai kurios bakterijos sukūrė atsparumą antibiotikams, o tai reiškia, kad jos gali nereaguoti į daugelį įprastų antibiotikų. Tai verčia vaistų įmones tirti naujus antibiotikus, kad galėtų aplenkti bakterijų mutacijas.