Fleita ir obojus yra medinių pučiamųjų šeimos nariai, tačiau jie labai skiriasi. Jie skiriasi statybine medžiaga, spalva, forma, tonu ir raktų apdaila. Grojimo padėtis, garso kokybė, nendrių naudojimas ar nebuvimas ir diapazonas taip pat yra reikšmingi skirtumai.
Vienas iš lengviausiai pastebimų obojaus ir fleitos skirtumų yra medžiagų, iš kurių profesionalai konstruoja instrumentus, pasirinkimas. Išskyrus metalinius raktus, obojus dažniausiai gaminamas iš grenadilės medienos, dar vadinamos Afrikos juodmedžiu. Rečiau obojus gaminamas iš kitų miškų, pavyzdžiui, raudonmedžio. Daugumos vakarietiškų koncertinių fleitų korpusas ir klavišai retai gaminami iš medžio, o iš metalo, dažniausiai sidabruoto žalvario. Kai kurie profesionalaus lygio žaidėjai groja su beveik visiškai sidabrinėmis fleitomis, o kai kurie naudoja aukso spalvą kandiklio lūpų atramos jungtyje arba klavišams, atsižvelgiant į tikslią grotuvo tono kokybę ir estetiką.
Obojus ir fleita skiriasi spalvomis dėl skirtingų statyboje naudojamų medžiagų. Obojus yra juodos spalvos, su sidabro spalvos klavišais. Fleitos paprastai būna visiškai sidabrinės spalvos, tačiau gali turėti gelsvai auksinę spalvą, priklausomai nuo naudojamo metalo.
Nesvarbu, kokios medžiagos buvo naudojamos obojui ar fleitai gaminti, dviejų instrumentų forma yra dar vienas skiriamasis veiksnys. Fleita atrodo kaip tiesus vamzdis. Skylė arba vidinė instrumento kamera, per kurią juda oras, yra cilindro formos. Didžioji obojaus dalis iš išorės taip pat atrodo apvali kaip vamzdis, tačiau viduje anga yra kūgio formos, siaurėjanti link platėjančio varpo. Šio pliūpsnio ant fleitos nerasta.
Žvelgiant į obojaus ir fleitos klavišus, obojus turi daugiau klavišų ir skylių. Fleita paprastai turi mažiausiai 16 angų, o obojus iš viso turi mažiausiai 22. Tikslus obojuje arba fleitoje esančių skylių skaičius priklauso nuo tikslaus instrumento modelio ir klasės.
Judant link tikrojo grojimo obojumi ir fleita, vakarietiška klasikinė fleita yra skersinis arba į šoną pučiamas instrumentas, o tai reiškia, kad ji laikoma ir grojama horizontaliai. Tam reikia, kad žaidėjas laikytų instrumentą dešinėje pusėje. Obojus yra galutinai pūstas instrumentas. Žaidėjas laiko instrumentą maždaug 45 laipsnių kampu priešais savo kūną, pūsdamas žemyn į viršutinį galą.
Be to, obojus yra „dvigubos nendrės“ instrumentai. Norėdami pagaminti nendrę, obojininkas perlenkia bambukinės lazdelės gabalėlį ant vamzdelio ir pririša jį į vietą. Tada jis nupjauna lazdelės galiuką, kad atskirtų ją į dvi atskiras dalis. Po to, kai obojininkas suformavo du nepriklausomus nendrių gabalus, sudarančius visą nendrę, jis įsideda nendrę į burną ir oro srove priverčia ją vibruoti.
Fleitos nendrių nenaudoja. Užuot priversti nendrę vibruoti, fleitininkai pučia orą tiesiai į fleitą. Oro srautas iš grotuvo priverčia vibruoti fleitos viduje esantį orą, o dalis šios vibracijos išeina iš fleitos galo ir tono skylių kaip aukštis.
Bet kurio instrumento kiaurymė smarkiai paveikia bendrą instrumento tonų kokybę, nes anga daro įtaką oro stulpelio elgsenai. Nendrių naudojimas arba nebuvimas taip pat turi įtakos tonui. Obojus gali būti labai garsus, skvarbus ir šiek tiek panašus į antį, bet taip pat gali skambėti itin šiltai ir mielai. Fleitos skamba arba skvarbiai, arba švelniai, atsižvelgiant į jų registrą, ir joms trūksta šiek tiek smėlio kokybės, kurią sukelia nendrė.
Obojaus ir fleitos diapazonas yra panašus, tačiau fleitos diapazonas yra šiek tiek didesnis nei obojaus. Obojus groja tarp Bb3 ir G6, nors patogesnė tessitūra yra nuo C4 iki Eb6. Fleitos diapazonas yra nuo B3 iki C7 arba maždaug trys oktavos. Tačiau ne visi obojus tęsiasi iki Bb3 ir panašiai, ne visų fleitų pėdos sąnarys yra pakankamai ilgas, kad sukurtų B3. Galimos natos, viršijančios šiuos bendruosius diapazonus, tačiau jos grojamos nereguliariai, yra sudėtingos įrangos ir tono išsaugojimo požiūriu ir reikalauja absoliučios atlikėjo kompetencijos.