Geriausias namų krosnies didelio efektyvumo kietųjų dalelių oro (HEPA) filtras yra toks, kuris pašalins alergenus tokiu lygiu, kuris būtinas, kad žmonės viduje jaustųsi patogiai. HEPA krosnies filtras turi sugebėti pašalinti 99.97 % visų dalelių, kurių matmenys yra 0.3 mikrono ar daugiau, kad būtų pažymėtas kaip toks. Krosnies filtro našumas vertinamas pagal minimalios efektyvumo ataskaitos vertės (MERV) skalę. Mažo skaičiaus filtrai išfiltruoja tik didžiausius nešvarumus ir dulkes, kad apsaugotų krosnies sistemą. Didelio skaičiaus filtrai, įskaitant HEPA filtrus, pašalina mažesnes daleles ir daugiau alergenų, kad pagerintų oro kokybę.
Kai kuriems žmonėms, turintiems rimtų alergijų ir kvėpavimo problemų, reikia pačių galingiausių turimų filtrų, o kitus tenkina filtrai su žemu MERV įvertinimu. Tie, kuriems reikia geresnio filtravimo, turėtų ieškoti filtrų, kurių MERV skalė yra nuo 12 iki 16. Tačiau perkant filtrus reikia žinoti svarbų skirtumą. Standartinis krosnies filtras, kurio storis 1 colis (2.54 cm), paprastai nėra tikras HEPA krosnies filtras. Vietoj to, tai HEPA tipo filtras, kuris neištrauks tiek daug dalelių iš oro.
Dauguma šiandien prieinamų alergiją sukeliančių krosnių filtrų, kurie vadinasi HEPA tipo filtrais, yra pagaminti panašiai kaip tikras HEPA krosnies filtras, tačiau nėra tokie tankūs ar veiksmingi. Jie nesugeba sugauti menkiausių dalelių. Jų efektyvumas gali siekti tik 85 %, kai dalelių dydis nukrenta žemiau 1 mikrono. Tikras HEPA krosnies filtras paprastai yra per tankus, kad veiktų daugelyje standartinių namų krosnių ir iš tikrųjų gali sukelti krosnies gedimą.
HEPA krosnies filtras yra toks tankus, kad krosnis turi dirbti sunkiau, kad ištrauktų orą per medžiagą. Kai kurios krosnių sistemos neturi pakankamai galios tai padaryti. Senesnėms krosnims gali būti ypač sunku. Jei sumontuotas labai aukšto MERV įvertinimo filtras arba tikras HEPA filtras, būtina patikrinti orą, patenkantį iš ventiliacijos angų. Jei oras teka ne taip stipriai, kaip prieš naują filtrą, tada filtras gali būti per tankus ir efektyvus tai krosnies sistemai.
Galima pasirinkti oro valytuvą su tikru HEPA filtravimu. Kita alternatyva tiems, kuriems dėl sveikatos reikia itin filtruoto oro – tarp oro grąžinimo angos ir krosnies įrengti specialų viso namo filtrą. Tai dažnai vadinama filtravimo terpės sistemomis. Jie naudoja filtrą, kurio storis gali būti nuo 3 iki 5 colių (apie 7.6–12.7 cm). Juose taip pat dažniausiai yra įmontuota sistema, padedanti per juos perkelti orą, nuimti naštą nuo krosnies.