Dažniausias plaukų persodinimo šalutinis poveikis yra plaukų slinkimas, žagsėjimas, niežulys, paraudimas ir galvos bei akių patinimas. Dauguma pacientų infekcijomis neserga, tačiau jas galima paminėti pakankamai dažnai, todėl gydytojai imasi daug atsargumo priemonių, kad jų išvengtų. Šalutinis poveikis gali skirtis priklausomai nuo asmens.
Vienas iš dažniausiai pasitaikančių plaukų persodinimo šalutinių poveikių yra plaukų slinkimas. Tai apima persodintus plaukus ir originalius plaukus. Ilgainiui persodintoje vietoje plaukai pradeda augti, o likusi galvos oda gali likti plonesnė nei buvo prieš operaciją. Tuo tarpu gali atsirasti plikų dėmių ar dėmių. Po kurio laiko plaukai turi būti paskirstyti per visą galvą.
Kitas vienas iš dažniausiai pasitaikančių plaukų persodinimo šalutinių poveikių yra niežulys. Stiprus niežulys ir paraudimas yra dažni po plaukų persodinimo ir gali trukti ilgiau nei kiti šalutiniai poveikiai. Svarbu nebraižyti vietos daugiau nei būtina dėl infekcijos pavojaus. Dažnai atsiranda šašai, dėl kurių niežulys sustiprėja. Norint sumažinti šį simptomą, gali būti skiriami vaistai.
Galvos ir akių patinimas taip pat gana dažnas po plaukų persodinimo operacijos. Paprastai jie yra trumpalaikiai ir nesukelia stipraus dirginimo. Tie, kurie kenčia nuo ilgalaikio atvejo, gali kreiptis patarimo į savo gydytojus ir gauti receptinius vaistus, kad sumažintų diskomfortą.
Infekcija yra vienas pavojingiausių plaukų persodinimo šalutinių poveikių. Tai nėra tokia dažna kaip kiti padariniai, tačiau gali sukelti didžiausią žalą. Tie, kuriems buvo atlikta transplantacija, yra labiau linkę užsikrėsti infekcija, nes per kelias dienas po operacijos oda būna uždegusi ir jautri. Daugelis gydytojų prieš ir po transplantacijos skyrė antibiotikų, kad išvengtų šio galimo šalutinio poveikio.
Pacientai, kuriems yra sunkus arba užsitęsęs plaukų persodinimo šalutinis poveikis, turėtų pasitarti su savo gydytojais dėl gydymo. Daugeliu atvejų diskomfortui sumažinti galima skirti vaistus, kol šios reakcijos išnyks. Kartais dirginimas gali išlikti, jei dėl procedūros kyla komplikacijų, todėl jas reikės kuo greičiau pašalinti.
Infekcijos požymiai po operacijos yra paraudimas, skausmas, patinimas, kraujavimas ir pūlių, kurie yra žali arba geltoni, išsiskyrimas. Jei atsiranda šių simptomų, reikia nedelsiant kreiptis į gydytoją. Antibiotikai ir antiseptiniai tepalai paprastai gali būti naudojami esamai infekcijai gydyti.