Dažniausiai naudojami tarpinio serverio nustatymai yra skirti tiesioginiam prisijungimui prie interneto, automatiniam aptikimui ir rankiniam konfigūravimui. Taip pat galima pasirinkti hiperteksto perdavimo protokolo (HTTP) tarpinius serverius ir SOCKS, tinklo tarpinio serverio protokolą, tarpinius serverius. Papildomi nustatymai apima talpyklos išvalymą ir saugų susiejimą.
Tiesioginio ryšio nustatymas naudojamas, kai vartotojas nori tiesiogiai prisijungti prie interneto, net jei naršyklė sukonfigūruota naudoti tarpinį serverį. Tai vienas iš paprasčiausių ir dažniausiai naudojamų tarpinio serverio nustatymų ir yra patogi funkcija, kai vartotojui reikia perjungti savo tikrąjį IP adresą ir tarpinį serverį. Kai naudojamas šis nustatymas, tarpinis serveris apeinamas.
Tarpinio serverio nustatymus taip pat galima aptikti automatiškai. Kai tinkle sujungtuose kompiuteriuose reikia naudoti tuos pačius tarpinio serverio nustatymus, galima nustatyti serverį ir sukurti specialų profilį naudojant .ins ir .cab failus. Tai greitas ir paprastas būdas valdyti tarpinio serverio nustatymus iš vienos centrinės vietos, nes kompiuteriai automatiškai aptinka teisingus nustatymus.
Rankinis konfigūravimas leidžia vartotojams ranka įvesti tarpinio serverio nustatymus. Šią funkciją paprastai galima pasiekti per interneto naršyklės meniu „Įrankiai“. Nustatymų skydelyje bus galima pasirinkti be tarpinio serverio, automatinio aptikimo, sistemos tarpinio serverio nustatymų ir rankinio konfigūravimo. Jei pasirenkama rankinė konfigūracija, vartotojas galės pasirinkti tarpinio serverio tipą, kurį jis ketina naudoti. Tada galima įterpti teisingą informaciją, kad būtų užbaigta konfigūracija.
Vartotojams dažnai bus suteikta galimybė pasirinkti tarp HTTP arba SOCKS tarpinių serverių, ypač kai naudojama tarpinio serverio programinė įranga. Vartotojas įveda tarpinio serverio adresą ir prievadą. Jei tai saugus tarpinis serveris, programinė įranga paragins vartotoją įvesti vartotojo vardą ir slaptažodį.
Talpyklos išvalymas yra kitas tarpinio serverio nustatymas. Jis apsaugo vartotojo duomenis išsaugotų slaptažodžių atveju. Kai kuriuose tarpinio serverio programinės įrangos paketuose taip pat yra galimybė išvalyti slapukus ir laikinus naršyklės failus, vartotojui atsijungus nuo tarpinio serverio.
Kai kurie tarpinio serverio programinės įrangos paketai taip pat siūlo saugų susiejimo nustatymą. Kai tai įjungta, vartotojas yra apsaugotas, net jei tarpinis serveris sugenda. Šis nustatymas nutraukia interneto ryšį, jei tarpinis serveris nustoja veikti, kol naudojamas, ir neleidžia atskleisti tikrojo vartotojo IP adreso. Tai patogi funkcija naudojant saugias svetaines arba kai IP adreso „nutekėjimas“ kelia susirūpinimą.