Terminas grafika reiškia piešinius ar vaizdus, kurie sukurti laikantis matematikos taisyklių. Molekulinė reiškia molekules ir jų komponentus. Todėl viena molekulinės grafikos (MG) reikšmė yra molekulių tyrimas vizualizuojant pačias molekules ir jų sudedamąsias dalis. Molekulinė grafika taip pat reiškia trimačius molekulių vaizdus, kurie daromi siekiant jas ištirti ir suprasti jų atsakymus reakcijų ir sąveikų metu.
Molekulinė grafika turi tam tikrų pranašumų, palyginti su fiziniais modeliais. Fiziniai modeliai gali sukelti problemų, nes struktūra yra neaiški, susidaro klaidingas lankstumo įspūdis, sudėjimas beveik neįmanomas arba tiesiog per sudėtinga dirbti su jais. Visas šias problemas galima įveikti naudojant kompiuterinę grafiką.
Vienas iš pagrindinių molekulinės grafikos panaudojimo būdų yra baltymų ir nukleino rūgščių tyrimas. Struktūrinės bioinformatikos tyrimų bendradarbis (RCSB) baltymų duomenų bankas (PDB), kuriame bendrai prieigai saugoma eksperimentiškai nustatyta informacija apie nukleorūgščių, baltymų ir kompleksinių mazgų struktūras. 27 m. balandžio 2010 d. duomenų bazėje buvo 64,932 3 struktūros. RCSB populiarina jų funkciją, kviesdama lankytojus kurti XNUMXD virusų modelius Rutgerso universitete Rutgerso dieną. RCSB taip pat remia baltymų modeliavimo bandymus regioninėse gamtos mokslų olimpiadose Jungtinėse Amerikos Valstijose. Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) yra tarptautinė organizacija, kuriai priklauso tokios grupės kaip RCSB; PDBe, Europos atitikmuo; ir PDBj, Japonijos atitikmuo; priklauso.
Kita sritis, kurioje molekulinė grafika yra nepaprastai svarbi, yra vaistų dizainas. Molekulinės grafikos pagalbinis vaistų projektavimas – taip pat žinomas kaip kompiuterinis vaistų projektavimas (CADD), kompiuterinis molekulinis projektavimas (CAMD) arba struktūrinis vaistų projektavimas (SBDD) – yra vienas iš pagrindinių fakulteto, dalyvaujančio šioje srityje, mokslinių tyrimų interesų. Virdžinijos Sandraugos universiteto Medicininės chemijos specializacija, pavyzdžiui, farmacijos mokslų studijų programose.
Speciali programinė įranga molekulinei grafikai kurti, vadinama molekulinio projektavimo programine įranga, yra prieinama daugelyje komercinių paketų. Taip pat yra tam tikrų versijų, skirtų molekuline grafika pagrįstam vaistų dizainui. Kuriant vaistus, prijungimo funkcija – galimybė prijungti rodomą molekulę prie receptoriaus – yra vienas iš pagrindinių atributų, išskiriančių vaistų projektavimo programinę įrangą nuo kitos molekulinio projektavimo programinės įrangos.