Nors pats griaustinis paprastai nėra pavojingas, išskyrus itin retas aplinkybes, perkūnija yra, nes ji yra susijusi su meteorologiniais reiškiniais, tokiais kaip žaibas, kurie gali būti labai pavojingi. Jei pastebite artėjančią perkūniją, stenkitės prisidengti patalpoje ir nesinaudokite telefonu ar kitais elektros prietaisais, būdami atokiai nuo langų. Jei per audrą jus užklupo lauke, kuo žemiau prisiglauskite prie žemės ir venkite pavienių medžių ar metalo, kurie gali pritraukti žaibą. Jei perkūnijos metu ką nors nutrenkė apšvietimas, kuo skubiau kreipkitės į medikus.
Keletas dalykų daro perkūniją pavojingą. Pirmasis – žaibas, lydintis daugumą perkūnijų. Žaibas yra elektros iškrova, atsirandanti dėl teigiamų ir neigiamų dalelių atsiskyrimo, kuri atsiranda daugelyje audrų sistemų, kai debesys stumdomi oru. Nutrenkęs žaibas žmogus gali žūti arba būti sunkiai sužalotas, žaibas taip pat apgadins namus ir kitą turtą. Nors mirtis ar sunkūs sužalojimai nuo žaibo smūgio yra reti, taip nutinka.
Perkūnija taip pat siejama su stipriu lietumi, vėju ir kruša. Pagrindinė mirties priežastis, susijusi su perkūnija, iš tikrųjų yra staigūs potvyniai, atsirandantys, kai per labai trumpą laiką iškrenta didelis kiekis lietaus. Kai kurios vietovės yra labiau linkusios į staigius potvynius nei kitos, tačiau jei jus užklumpa perkūnija, saugokitės nuotakų ir įlankų, kurios gali surinkti vandenį staigios potvynio metu. Stiprus vėjas gali padaryti žalos turtui ir nuvirsti medžius bei elektros linijas, o tai gali sukelti pavojų, o kruša gali būti mirtina, jei gabaliukai yra pakankamai dideli, arba bent jau sukelti rimtų mėlynių.
Kai kuriose vietovėse tornadai yra susiję su perkūnija. Nors taip nutinka ne visada, tornadas gali būti labai pavojingas jame užkluptiems žmonėms, o jei jis tampa pakankamai didelis, gali padaryti žalos turtui. Jei gyvenate vietovėje, kurioje siaučia tornadai, perkūnijos metu reikėtų pasislėpti rūsyje, kad išvengtumėte galimo niokojančio pojūčio, kai jus užklupo viesulas.
Jei turite mažų vaikų, įsitikinkite, kad jie supranta saugumą perkūnijos metu, ypač jei gyvenate regione, kuriame perkūnija dažnai būna. Žinokite, kad žaibas taip pat gali atsitiktinai trenkti toli nuo perkūnijos, todėl jei girdite ar matote perkūniją, turėtumėte imtis priemonių apsisaugoti. Taip pat galbūt norėsite nešioti ausų apsaugos priemones, nes griaustinis aukštas decibelų lygis gali turėti įtakos jūsų klausai arba kelias dienas spengti ausyse.